G - Physics – 01 – R
Patent
G - Physics
01
R
G01R 33/465 (2006.01) G01N 33/68 (2006.01)
Patent
CA 2413071
The present invention discloses eight new redueced dimensionality (RD) triple resonance nuclear magnetic resonance (NMR) experiements for measuring chemical shift values of certain nuclei in a protein molecule. The RD 3D HA,CA,(CO),N,HN NMR experiment and the RD 3D H,C,(C-TOCSY-CO),N,HN NMR experiment are designed to yield "sequential" connectivities, while the RD 3D H.alpha..beta.,C.alpha..beta.,CO,HA NMR experiment and the RD 3D H.alpha..beta.,C.alpha..beta.,N,HN NMR experiment provide "intraresidue" connectivties. The RD 3D H,C,H-COSY NMR experiment, the RD 3D H,C,C, H-TOCSY NMR experiment, and the RD 2D H,C,H-COSY NMR experiment allow one to obtain assignments for aliphatic and aromatic side chain chemical shifts, while the RD 2D HB,CB;(CG,CD),HD NMR experiment provide information for the aromatic side chain chemical shifts. In addition, a method of conducting suites of RD triple resonance NMR experiments for high-throughput resonance assignment of proteins and identification of the location of secondary structure elements are disclosed.
Cette invention décrit huit nouvelles expériences de résonance magnétique nucléaire (RMN) à résonance triple de dimensionnalité réduite (DR) pour mesurer les valeurs de déplacement chimique de certains noyaux dans une molécule de protéine. L'expérience RMN DR3D<U>HA</U>,<U>CA</U>,(CO),N,HN et l'expérience RMN DR 3D<U>H</U>,<U>C</U>,(C-TOCSY-CO),N,HN sont conçues pour produire des connectivités "séquentielles", alors que l'expérience RMN DR 3D <U>H</U>?.alpha..beta.¿,C?.alpha..beta.¿,CO,HA et l'expérience RMN DR 3D <U>H</U>?.alpha..beta.¿,<U>C</U>?.alpha..beta.¿,N,HN fournissent des connectivités "intrarésidu". L'expérience RMN DR 3D <U>H</U>,<U>C</U>,C,H-COSY, l'expérience RMN DR 3D <U>H</U>,<U>C</U>,C,H-TOCSY et l'expérience RMN DR 2D <U>H</U>,<U>C</U>,H-COSY permettent d'obtenir des attributions pour les déplacements chimiques de chaînes latérales aliphatiques et aromatiques, alors que l'expérience RMN DR 2D <U>HB</U>,<U>CB</U>,(CG,CD),HD fournissent des informations pour les déplacements chimiques de chaînes latérales aromatiques. Cette invention concerne en outre un procédé permettant d'effectuer des séries d'expériences RMN à triple résonance DR pour l'attribution par résonance de protéines avec un fort rendement et pour l'identification de la position d'éléments de structure secondaire.
Gowling Lafleur Henderson Llp
The Research Foundation Of State University Of New York
LandOfFree
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Profile ID: LFCA-PAI-O-1869370