Method to detect and analyze tight-binding ligands in...

G - Physics – 01 – N

Patent

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G01N 27/447 (2006.01)

Patent

CA 2336746

The invention combines a capillary electrophoresis (CE) technique for screening complex biological samples with mass spectrometry (MS), to provide a streamlined procedure for identifying and characterizing candidate ligands in a complex biological sample that bind at a selected binding strength to a selected target molecule. The method of the invention advantageously identifies and characterizes tight-binding ligands when high concentrations of weak ligands are present in the sample, which may mask lower concentrations of tight-binding ligands in the sample. The method involves interfacing a capillary from a CE instrument with a post-capillary mass spectrometer to provide direct mass analysis of target/ligand complexes that migrate stably through the CE instrument. All weaker-binding ligands will not be detected during the MS analysis because they dissociate from the target early during the CE run, before reaching and entering the mass spectrometer. Therefore, this method can identify and structurally characterize moderate-to-tight- binding ligands in complex biological samples, even in the presence of high concentrations of weak-binding ligands.

La présente invention associe une technique d'électrophorèse capillaire (CE) pour cribler des échantillons biologiques complexes à une technique de spectrométrie de masse (MS), de manière à fournir un procédé rationalisé d'identification et de caractérisation de ligands candidats contenus dans un échantillon biologique complexe, se fixant à une molécule cible sélectionnée avec une force de fixation sélectionnée. Le procédé de cette invention identifie et caractérise avantageusement les ligands à forte fixation lorsque de fortes concentrations de ligands faibles sont présentes dans l'échantillon, masquant ainsi les faibles concentrations de ligands à forte fixation dans l'échantillon en question. Ce procédé consiste à relier un capillaire d'un instrument CE avec un spectromètre de masse post-capillaire pour fournir une analyse de masse directe des complexes cible/ligand migrants de manière stable à travers l'instrument CE. Tous les ligands à fixation faible ne sont pas détectés pendant l'analyse MS car ils se dissocient rapidement de la cible pendant le fonctionnement de la CE, avant d'atteindre et de pénétrer le spectromètre de masse. Par conséquent, ce procédé peut identifier et caractériser structurellement les ligands de fixation forte à modérée dans un échantillon biologique complexe, même en présence de fortes concentrations de ligands à fixation faible.

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