Method to rapidly detect and identify common bacterial...

C - Chemistry – Metallurgy – 07 – H

Patent

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C07H 21/04 (2006.01) C12N 15/31 (2006.01) C12Q 1/68 (2006.01) C12P 19/34 (2006.01)

Patent

CA 2270281

DNA-based methods employing amplification primers or probes for detecting, identifying, and quantifying in a test sample DNA from (i) any bacterium, (ii) the species Streptococcus agalactiae, Staphylococcus saprophyticus, Enterococcus faecium, Neisseria meningitidis, Listeria monocytogenes and Candida albicans, and (iii) any species of the genera Streptococcus, Staphylococcus, Enterococcus, Neisseria and Candida are disclosed. DNA-based methods employing amplification primers or probes for detecting, identifying, and quantifying in a test sample antibiotic resistance genes selected from the group consisting of bla tem, bla rob, bla shv, bla oxa, blaZ, aadB, aacC1, aacC2, aacC3, aacA4, aac6'-IIa, ermA, ermB, ermC, mecA, vanA, vanB, vanC, satA, aac(6'-aph(2"), aad(6'), vat, vga, msrA, sul and int are also disclosed. The above microbial species, genera and resistance genes are all clinically relevant and commonly encountered in a variety of clinical specimens. These DNA-based assays are rapid, accurate and can be used in clinical microbiology laboratories for routine diagnosis. These novel diagnostic tools should be useful to improve the speed and accuracy of diagnosis of microbial infections, thereby allowing more effective treatments. Diagnostic kits for (i) the universal detection and quantification of bacteria, and/or (ii) the detection, identification and quantification of the above-mentioned bacterial and fungal species and/or genera, and/or (iii) the detection, identification and quantification of the above-mentioned antibiotic resistance genes are also claimed.

L'invention concerne des procédés basés sur l'ADN employant des amorces d'amplification ou des sondes pour détecter, identifier et quantifier dans un échantillon à analyser de l'ADN provenant (1) de toute bactérie, (2) des espèces Streptococcus agalactiae, Staphylococcus saprophyticus, Enterococcus faecium, Neisseria meningitidis, Listeria monocytogenes et Candida albicans, et (3) de toute espèce du genre Streptococcus, Staphylococcus, Enterococcus, Neisseria et Candida. L'invention concerne également des procédés basés sur l'ADN employant des amorces d'amplification ou des sondes pour détecter, identifier, et quantifier dans un échantillon à analyser des gènes de résistance à des antibiotiques sélectionnés dans le groupe constitué par bla?tem?, bla?rob?, bla?shv?, bla?oxa?, blaZ, aadB, aacC1, aacC2, aacC3, aacA4, aac6'-IIa, ermA, ermB, ermC, mecA, vanA, vanB, vanC, satA, aac(6'-aph(2''), aad(6'), vat, vga, msrA, sul et int. Les espèces microbiennes, les genres et les gènes de résistance mentionnés sont tous pertinents d'un point de vue clinique, et se rencontrent fréquemment dans divers prélèvements cliniques. Ces analyses basées sur l'ADN sont rapides, précises et peuvent être utilisées en laboratoire de microbiologie clinique pour des diagnostics de routine. Ces nouveaux outils de diagnostic devraient être utiles pour améliorer la rapidité et la précision de diagnostics d'infections microbiennes, ce qui permet d'obtenir des traitements plus efficaces. Des kits de diagnostic pour (1) la détection universelle et la quantification de bactéries et/ou (2) la détection, l'identification et la quantification des espèces et/ou des genres bactériens et fongiques mentionnés, et/ou (3) la détection, l'identification et la quantification des gènes mentionnés de résistance à des antibiotiques sont également décrits.

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