G - Physics – 06 – F
Patent
G - Physics
06
F
G06F 19/00 (2006.01)
Patent
CA 2468570
Methods and apparatus for use in genetic trait classification involving at least two genes associated with a genetic trait are described. In one illustrative method, a value for use in classifying an individual into one of a plurality of trait classes associated with the genetic trait is calculated. The value is calculated based on (1) a sum of contributions associated with each genotype of a plurality of genotypes of the at least two genes identified for the individual, where the contributions for each genotype are identified at least in part from statistical associations between the genotypes and each trait class identified in a sample population; and (2) a sum of contributions associated with each one of one or more genotype combinations between the at least two genes identified in the individual, where the contributions for the one or more genotype combinations are identified at least in part from statistical associations between the genotype combinations and each trait class identified in the sample population. Advantageously, epistasis as well as additivity and dominance affects are taken into account for more accurate genetic trait classifications.
La présente invention concerne des méthodes et un appareil destinés à être utilisés dans la classification de traits génétiques impliquant au moins deux gènes associés à un trait génétique. Selon une méthode de l'invention, une valeur destinée à être utilisée dans la classification d'un individu dans une classe d'une pluralité de classes de traits associées au trait génétique est calculée. Ladite valeur est calculée en fonction (1) d'une somme de contributions associées à chaque génotype d'une pluralité de génotypes des deux gènes identifiés pour l'individu, les contributions pour chaque génotype étant identifiées au moins en partie à partir d'associations statistiques entre les génotypes et chaque classe de trait identifiée dans une population d'échantillon; et (2) d'une somme de contributions associées à chacune des combinaisons de génotypes entre les deux gènes identifiés chez l'individu, les contributions pour les combinaisons de génotypes étant identifiées au moins en partie à partir d'associations statistiques entre les combinaisons de génotypes et chaque classe de trait identifiée dans la population d'échantillon. De manière avantageuse, l'épistasie ainsi que les effets d'additivité et de dominance sont pris en compte pour des classifications de traits génétiques plus précises.
Dnaprint Genomics Inc.
Sim & Mcburney
LandOfFree
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Profile ID: LFCA-PAI-O-1472570