Methods and compositions for amplification of rna sequences

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – P

Patent

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Details

C12P 19/34 (2006.01) C12Q 1/68 (2006.01)

Patent

CA 2416963

The invention provides methods for isothermal amplification of RNA. The methods are particularly suitable for amplifying a plurality of RNA species in a sample. The methods employ a composite primer, a second primer and strand displacement to generate multiple copies of DNA products comprising sequences complementary to an RNA sequence of interest. In another aspect, the methods employ a single primer (which is a composite primer) and strand displacement to generate multiple copies of DNA products comprising sequences complementary to an RNA sequence of interest. In some embodiments, a transcription step is included to generate multiple copies of sense RNA of an RNA sequence of interest. The methods are useful for preparation of nucleic acid libraries and substrates for analysis of gene expression of cells in biological samples. The invention also provides compositions and kits for practicing the amplification methods, as well as methods which use the amplification products.

Cette invention concerne des procédés permettant l'amplification isotherme d'ARN. Ces procédés se prêtent tout particulièrement à l'amplification de plusieurs espèces d'ARN dans un échantillon. Les procédés consistent à utiliser une amorce composite, une seconde amorce, ainsi que le déplacement de brins pour produire plusieurs copies de produits ADN comprenant des séquences complémentaires d'une séquence d'ARN présentant un intérêt. Un autre aspect de cette invention concerne des procédés qui consistent à utiliser une seule amorce (qui est une amorce composite) et le déplacement de brins, pour produire plusieurs copies de produits d'ADN comprenant des séquences complémentaires d'une séquence d'ARN présentant un intérêt. Dans certains modes de réalisation, une étape de transcription est ajoutée pour produire plusieurs copies d'ARN sens d'une séquence d'ARN présentant un intérêt. Les procédés décrits dans cette invention sont utiles pour la préparation de substrats et de bibliothèques d'acides nucléiques destinés à l'analyse de l'expression génique de cellules dans des échantillons biologiques. La présente invention concerne également des compositions et des trousses permettant de mettre en oeuvre les procédés d'amplification, ainsi que des procédés consistant à utiliser les produits de l'amplification.

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