Methods and compositions for detecting a drug resistant egfr...

C - Chemistry – Metallurgy – 07 – H

Patent

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C07H 21/04 (2006.01) C07H 21/00 (2006.01) C12P 19/34 (2006.01) C12Q 1/68 (2006.01) C12N 15/18 (2006.01)

Patent

CA 2597673

Polymerase chain reaction primers and methods directed to detecting the EGFR mutant C.fwdarw.T at the position corresponding to base 2369 of EGFR cDNA. The invention provides a PCR primer that hybridizes under suitable PCR conditions to a polynucleotide sequence 5' in each respective strand to a mutation of an EGFR gene that encodes a substitution of threonine by methionine at position 790 of the EGFR polypeptide. The invention also provides a PCR primer hybridizes to a sequence that includes a mutant T at the position corresponding to base 2369 of EGFR cDNA but not to a second EGFR polynucleotide containing a wild type C. The invention provides several methods and kits for detecting a mutant epidermal growth factor receptor (EGFR) gene in a sample comprising probing the sample with a means for selectively detecting a nucleotide sequence comprising a mutant T at the position corresponding to base 2369 of EGFR cDNA, and identifying that the base at said position is T. These methods and kits are also useful to predict resistance to the therapeutic effects of gefitinib or erlotinib in a subject suffering from or suspected of having a cancer.

L'invention concerne des amorces de réaction en chaîne de la polymérase ainsi que des méthodes permettant de détecter le mutant d'EGFR C?T à la position correspondant à la base 2369 de l'ADNc d'EGFR. L'invention concerne une amorce PCR qui s'hybride dans des conditions de PCR appropriées avec une séquence polynucléotidique 5' dans chaque brin respectif pour une mutation d'un gène EGFR qui code pour une substitution de la thréonine par une méthionine à la position 790 du polypeptide EGFR. L'invention concerne également une amorce PCR qui s'hybride avec une séquence qui comprend un mutant T à la position correspondant à la base 2369 de l'ADNc d'EGFR mais pas avec un second polynucléotide EGFR contenant un C de type sauvage. L'invention concerne diverses méthodes et trousses de détection d'un gène du récepteur du facteur de croissance épidermique (EGFR) mutant dans un échantillon, lesdites méthodes consistant à sonder l'échantillon à l'aide d'un moyen permettant de détecter sélectivement une séquence nucléotidique comprenant un mutant T à la position correspondant à la base 2369 de l'ADNc d'EGFR, ainsi qu'à établir que la base à ladite position est T. Lesdites méthodes et trousses sont également utiles pour prédire une résistance aux effets thérapeutiques du gefitinib ou de l'erlotinib chez un sujet atteint d'un cancer ou suspecté de présenter un cancer.

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