Methods and compositions for determining the sequence of...

C - Chemistry – Metallurgy – 07 – H

Patent

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Details

C07H 21/00 (2006.01) C12Q 1/68 (2006.01) C07B 61/00 (2006.01)

Patent

CA 2243560

Methods and compounds, including compositions therefrom, are provided for determining the sequence of nucleic acid molecules. The methods permit the determination of multiple nucleic acid sequences simultaneously. The compounds are used as tags to generate tagged nucleic acid fragments which are complementary to a selected target nucleic acid molecule. Each tag is correlative with a particular nucleotide and, in a preferred embodiment, is detectable by mass spectrometry. Following separation of the tagged fragments by sequential length, the tags are cleaved from the tagged fragments. In a preferred embodiment, the tags are detected by mass spectrometry and the sequence of the nucleic acid molecule is determined therefrom. The individual steps of the methods can be used in automated format, e.g., by the incorporation into systems.

La présente invention concerne des procédés et des composés, ainsi que des compositions obtenues à partir de ces derniers, permettant de déterminer la séquence de molécules d'acides nucléiques. Ces procédés permettent la détermination simultanée de multiples séquences d'acides nucléiques. Les composés s'utilisant comme étiquette permettent de générer des fragments d'acides nucléiques étiquetés qui sont complémentaires d'une molécule d'acide nucléique cible. Chaque étiquette est en corrélation avec un nucléotide particulier, et selon une réalisation préférée, est détectable par spectrométrie de masse. Après séparation des fragments étiquetés en longueurs séquentielles, les étiquettes sont séparées par clivage des fragments étiquetés. Dans une réalisation préférée, la détection des étiquettes se fait par spectrométrie de masse, la détermination de la séquence de la molécule d'acide nucléique découlant de cette détection d'étiquettes. Les différentes opérations mises en oeuvre pour le procédé peuvent s'utiliser en un format automatisé, par exemple, par incorporation dans des systèmes.

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