G - Physics – 01 – N
Patent
G - Physics
01
N
G01N 33/68 (2006.01) C07K 1/14 (2006.01) G01N 1/34 (2006.01) G01N 1/40 (2006.01) G01N 33/53 (2006.01) G01N 33/543 (2006.01) G01N 33/566 (2006.01) G01N 30/72 (2006.01)
Patent
CA 2443515
Methods and reagents for obtaining simplified mixtures of peptides from a sample containing a number of peptides are disclosed. The simplified sample can be easier to analyze than the original peptide sample yet it is representative of all or nearly all of the proteins present in the mixed protein sample from which the original and more complex peptide sample was derived. The methods entail the use of tagging moieties that include an amino- acid-specific reactive group (R). The tagging moieties "tag" peptides or proteins at specific amino acids (e.g., by reacting with an amino acid to form a covalent bond), ultimately allowing the isolation of peptides that contain those specific amino acids. Other methods entail the used of a reactive moiety (Rp) that comprises a reagent that selectively interacts with selected proteins, either covalently or noncovalently. For example, Rp can be a natural ligand for a receptor that is to be taged or a protein that interacts with a second protein that is to be tagged. It can be an enzymatic substrate or other element of molecular recognition such as an antibody, ATP, GTP, NAD, NADP, NADH, NADPH, ubiquitin, or structural analogs thereof.
La présente invention concerne des méthodes et des réactifs permettant d'obtenir des mélanges simplifiés de peptides à partir d'un échantillon contenant un certain nombre de peptides. L'échantillon simplifié peut être plus facile à analyser que l'échantillon de peptide original encore représentatif de toutes ou de presque toutes les protéines présentes dans l'échantillon de protéine mélangé à partir duquel l'échantillon de peptide original et plus complexe est dérivé. Lesdites méthodes entraînent l'utilisation de fragments de marquage qui comprennent un groupe réactif (R) spécifique aminoacide. Les fragments de marquage "marquent" des peptides ou des protéines situés sur des aminoacides spécifiques (par exemple, par réaction avec un aminoacide pour former une liaison covalente), permettant par conséquent l'isolation de peptides qui contiennent ces aminoacides spécifiques. D'autres méthodes entraînent l'utilisation d'un fragment réactif (R¿p?) qui comprend un réactif qui interagit sélectivement avec des protéines sélectionnées, de manière covalente ou non covalente. Par exemple, R¿p? peut être un ligand naturel pour un récepteur qui doit être marqué ou une protéine qui interagit avec une seconde protéine qui doit être marquée. Il peut être un substrat enzymatique ou un autre élément de reconnaissance moléculaire tel qu'un anticorps, ATP, GTP, NAD, NADP, NADH, NADPH, ubiquitine, ou des analogues structurels.
Smart & Biggar
Thermo Finnigan Llc
LandOfFree
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Profile ID: LFCA-PAI-O-1710512