C - Chemistry – Metallurgy – 12 – N
Patent
C - Chemistry, Metallurgy
12
N
C12N 15/74 (2006.01) C12P 19/02 (2006.01) G01N 33/50 (2006.01)
Patent
CA 2621562
A non-naturally occurring microorganism comprising one or more gene disruptions encoding an enzyme associated with growth-coupled production of succinate when an activity of the enzyme is reduced, whereby the one or more disruptions confers stable growth-coupled production of succinate onto the non- naturally occurring microorganism is provided. The disruptions can be complete gene disruptions, and the non-naturally occurring organisms can include a variety of prokaryotic or eukaryotic microorganisms. A method of producing a non-naturally occurring microorganism having stable growth-coupled production of succinate is also provided. The method includes: (a) identifying in silico a set of metabolic modifications requiring succinate production during exponential growth, and (b) genetically modifying a microorganism to contain the set of metabolic modifications requiring succinate production.
La présente invention concerne un micro-organisme d'origine non naturelle comprenant une ou plusieurs disruptions géniques codant une enzyme associée à la production de succinate couplée à la croissance lorsqu'une activité de l'enzyme est réduite, la ou les disruptions géniques conférant une certaine stabilité de production de succinate couplée à la croissance au micro-organisme d'origine non naturelle. Cette invention concerne également un micro-organisme d'origine non naturelle comprenant un ensemble de modifications métaboliques couplant obligatoirement la production de succinate à la croissance du micro-organisme, l'ensemble de modifications métaboliques comprenant la disruption d'un ou plusieurs gènes sélectionnés à partir de l'ensemble de gènes comprenant: (a)adhE, ldhA; (b) adhE, ldhA, ackA-pta; (c) pfl, ldhA; (d) pfl, IdhA, adhE; (e) ackA-pta, pykF, atpF, sdhA; (f) ackA-pta, pykF, ptsG, ou (g) ackA-pta, pykF, ptsG, adhE, IdhA, ou un orthologue de ceux-ci, lequel micro-organisme présente une certaine stabilité de production de succinate couplée à la croissance. En outre, cette invention concerne un micro-organisme d'origine non naturelle comportant les gènes codant la modification métabolique (e) ackA-pta, pykF, atpF, sdhA qui comprend également une disruption d'au moins un gène sélectionné parmi pykA, atpH, sdhB ou dhaKLM; un micro-organisme d'origine non naturelle comportant les gènes codant la modification métabolique (f) ackA-pta, pykF, ptsG qui comprend également une disruption d'au moins un gène sélectionné parmi pykA ou dhaKLM, ou un micro-organisme d'origine non naturelle comportant les gènes codant la modification métabolique (g) ackA-pta, pykF, ptsG, adhE, IdhA qui comprend également une disruption d'au moins un gène sélectionné parmi pykA ou dhaKLM. Les disruptions peuvent être des disruptions génique totales et les organismes d'origine non naturelle peuvent comprendre une variété de micro-organismes procaryotes ou eucaryotes. Cette invention concerne également un procédé de production d'un micro-organisme d'origine non naturelle présentant une certaine stabilité de production de succinate couplée à la croissance. Le procédé consiste: (a) à identifier in silico un ensemble de modifications métaboliques nécessitant une production de succinate pendant la croissance exponentielle; et (b) à modifier génétiquement un micro-organisme pour qu'il contienne l'ensemble de modifications métaboliques nécessitant la production de succinate.
Burgard Anthony P.
Van Dien Stephen J.
Genomatica Inc.
Smart & Biggar
LandOfFree
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