Methods and systems for analyzing fluorescent materials with...

G - Physics – 01 – N

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G01N 21/64 (2006.01) C12M 1/34 (2006.01) C12Q 1/68 (2006.01) C40B 60/00 (2006.01) G01N 33/52 (2006.01)

Patent

CA 2687062

Mitigative and remedial approaches to reduction of autofluorescence background noise are applied in analytical systems that rely upon sensitive measurement of fluorescent signals from arrays of fluorescent signal sources. Such systems are for particular use in fluorescence based sequencing by incorporation systems that rely upon small numbers or individual fluorescent molecules in detecting incorporation of nucleotides in primer extension reactions. Systems and methods for analyzing highly multiplexed sample arrays using highly multiplexed, high-density optical systems to illuminate high- density sample arrays and/or provide detection and preferably confocal detection off signals emanating from such high-density arrays. Systems and methods are applied in a variety of different analytical operations, including analysis of biological and biochemical reactions, including nucleic acid synthesis and derivation of sequence information from such synthesis.

Des approches réductrices et correctives permettant de limiter le bruit parasite d'autofluorescence sont appliquées dans les systèmes analytiques reposant sur la mesure sensible de signaux fluorescents émis par des réseaux de sources de signaux fluorescents. Ces systèmes sont particulièrement utiles dans le séquençage basé sur la fluorescence par des systèmes d'intégration reposant sur des petits effectifs ou des molécules fluorescentes individuelles qui détectent l'intégration de nucléotides dans des réactions d'extension d'amorces. L'invention concerne des systèmes et des procédés permettant d'analyser des réseaux d'échantillons extrêmement multiplexés en utilisant des systèmes optiques de haute densité, fortement multiplexés, pour éclairer les réseaux d'échantillons de haute densité et/ou obtenir une détection et de préférence une détection confocale sans signaux émanant de ces réseaux de haute densité. Les systèmes et les procédés sont appliqués selon diverses opérations analytiques différentes, y compris l'analyse de réactions biologiques et biochimiques, y compris la synthèse d'acides nucléiques et la dérivation d'informations de séquences provenant de cette synthèse.

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