C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q
Patent
C - Chemistry, Metallurgy
12
Q
C12Q 1/70 (2006.01)
Patent
CA 2632380
The invention provides methods for designing polynucleotide primers and probes that are optimized for hybridizing to a plurality of target nucleic acid variants by employing scoring and/or ranking steps that provide a positive or negative preference or "weight" to certain nucleotides in a candidate nucleic acid sequence. The particular scoring or ranking steps performed depend upon the intended use for the primer and/or probe, the particular target sequence, and the number of variants of that target sequence. The methods of the invention provide optimal primer and probe sequences because they hybridize to more target nucleic acid variants than primers and probes in the prior art.
La présente invention concerne des procédés destinés à concevoir des amorces et des sondes polynucléotidiques qui sont optimisées pour s~hybrider avec plusieurs variantes d'acides nucléiques cibles en employant des étapes de notation et/ou de classement qui permettent une préférence positive ou négative ou une « masse » pour certains nucléotides dans une séquence d~acide nucléique candidate. Les étapes de classement ou de notation particulières réalisées dépendent de l~utilisation à laquelle l~amorce et/ou la sonde sont destinées, de la séquence cible particulière, et du nombre de variantes de cette séquence cible. Les procédés de la présente invention permettent d~obtenir des séquences d~amorce et de sonde optimales dans la mesure où elles s~hybrident avec un plus grand nombre de variantes d~acides nucléiques cibles que ne le faisaient des amorces et sondes de la technique antérieure.
Hully James R.
Kedem Gilead
Lauer Raymond P.
Intelligent Medical Devices Inc.
Mbm Intellectual Property Law Llp
LandOfFree
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Profile ID: LFCA-PAI-O-2076060