Methods and systems to identify operational reaction pathways

Details Methods and systems to identify operational reaction pathways Methods and systems to identify operational reaction pathways

G - Physics

06

N

G06N 3/00 (2006.01) G01N 33/50 (2006.01)

Patent

CA 2500761

The present invention provides a method for identifying an operational reaction pathway of a biosystem. The method includes (a) providing a set of systemic reaction pathways though a reaction network representing said biosystem, (b) providing a set of phenomenological reaction pathways of said biosystem, and (c) comparing said set of systemic reaction pathways with said set of phenomenological reaction pathways, wherein a pathway common to said sets is an operational reaction pathway of said biosystem. Also described is a method of refining a biosystem reaction network; a method of reconciling biosystem data sets; a method of determining the effect of a genetic polymorphism on whole cell function; and a method of diagnosing a genetic polymorphism-mediated pathology.

L'invention concerne un procédé d'identification d'une voie réactionnelle fonctionnelle d'un biosystème. Le procédé consiste (a) à utiliser un ensemble de voies réactionnelles systémiques dans un réseau réactionnel représentant le biosystème ; (b) à utiliser un ensemble de voies réactionnelles phénoménologiques du biosystème ; et (c) à comparer l'ensemble de voies réactionnelles systémiques avec l'ensemble de voies réactionnelles phénoménologiques, une voie commune aux ensembles étant une voie réactionnelle fonctionnelle du biosystème. L'invention concerne également un procédé permettant de purifier un réseau réactionnel d'un biosystème; un procédé permettant de rapprocher des ensembles de données d'un biosystème; un procédé permettant de déterminer l'effet d'un polymorphisme génétique sur l'ensemble de la fonction cellulaire; et une méthode de diagnostic d'une pathologie induite par un polymorphisme génétique.

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