Methods for assay and detection on a microarray

C - Chemistry – Metallurgy – 07 – H

Patent

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Details

C07H 21/00 (2006.01) C07H 21/04 (2006.01) C12M 1/36 (2006.01) C12Q 1/68 (2006.01)

Patent

CA 2400680

Methods are provided for assay and detection on a microarray. The method of the present invention comprises incubating a mixture including: i) a first component comprising a cDNA reagent obtained from mRNA of a target sample, the cDNA having a capture sequence, and ii) a second component comprising a dendrimer having at least one first arm containing a label capable of emitting a detectable signal and at least one second arm having a second nucleotide sequence complementary to the capture sequence, at a first temperature and for a time sufficient to induce the first component to bind to the second component and form a prehybridized cDNA-dendrimer complex; contacting a microarray having thereon a plurality of features each containing a particular first nucleotide sequence with the mixture; and incubating the microarray and the prehybridized cDNA-dendrimer complex at a second temperature and for a time sufficient to induce prehybridized cDNA-dendrimer complex to bind to the first nucleotide sequence, wherein such binding results in the feature emitting the detectable signal whereby a hybridization pattern is generated on the microarray.

L'invention porte sur une consistant à faire incuber, un mélange comportant: (i) un premier composant comprenant un réactif d'ADNc présentant une séquence de capture obtenu à partir d'un échantillon cible; et ii) un deuxième composant comprenant un dendrimère présentant au moins un premier bras contenant un marqueur capable d'émettre un signal détectable, et au moins un deuxième bras présentant une deuxième séquence nucléotidique complémentaire de la séquence de capture, à une première température et pendant un temps suffisant pour induire la fixation du premier composant sur le deuxième composant de manière à former un complexe ADNc-dendrimère préhybridé; à mettre en contact un micro-réseau présentant sur lui plusieurs objets contenant chacun une première séquence nucléotidique particulière, avec le mélange; puis à faire incuber le micro-réseau et le complexe ADNc-dendrimère préhybridé à une deuxième température et pendant un temps suffisant pour induire la fixation dudit complexe à la première séquence nucléotidique, ladite fixation se traduisant par l'émission par un des objets d'un signal détectable et par la formation d'un motif d'hybridation sur le micro-réseau.

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