Methods for cleaving dna with nucleotide integrases

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q

Patent

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Details

C12Q 1/68 (2006.01)

Patent

CA 2282737

The present invention provides methods, using a nucleotide integrase, for cleaving nucleic acids substrates at specific sites and inserting a nucleic acid molecule into the cleaved substrate. The method of cleaving one strand of a double-stranded DNA substrate comprises providing a nucleotide integrase comprising a group II-intron RNA having two hybridizing sequences capable of hybridizing with two intron RNA binding sequences on the one strand of the substrate and a group II-intron encoded protein which binds to a first sequence element of the substrate. The method of cleaving both strands of a double-stranded DNA substrate comprises providing a nucleotide integrase comprising a group II-intron RNA having two hybridizing sequences capable of hybridizing with two intron RNA binding sequences on one strand of the substrate and a group II-intron encoded protein capable of binding to first and second sequence elements in the recognition site of the substrate. The method of cleaving a single-stranded nucleic acid substrate comprises providing an integrase having two hybridizing sequences capable of hybridizing with two intron RNA-binding sequences of the substrate and a group II-intron encoded protein.

La présente invention se rapporte à des procédés permettant de cliver, au moyen d'une intégrase nucléotidique, des substrats d'acides nucléiques au niveau de sites spécifiques, et d'insérer une molécule d'acide nucléique dans le substrat clivé. Ledit procédé de clivage d'un brin d'un substrat d'ADN double brin consiste à utiliser une intégrase nucléotidique comportant un ARN d'intron du groupe II ayant deux séquences d'hybridation susceptibles de s'hybrider à deux séquences de liaison à l'ARN d'intron sur ledit brin du substrat et une protéine codée par l'intron du groupe II qui se lie à un élément de la première séquence du substrat. Le procédé de clivage des deux brins d'un substrat d'ADN double brin consiste à utiliser une intégrase nucléotidique comportant un ARN d'intron du groupe II ayant deux séquences d'hybridation susceptibles de s'hybrider à deux séquences de liaison à l'ARN d'intron sur un brin du substrat et une protéine codée par l'intron du groupe II susceptible de se lier à des éléments des première et seconde séquences au niveau du site de reconnaissance du substrat. Le procédé de clivage d'un substrat d'acide nucléique simple brin consiste à utiliser une intégrase ayant deux séquences d'hybridation susceptibles de s'hybrider à deux séquences de liaison à l'ARN d'intron sur le substrat et une protéine codée par un intron du groupe II.

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