G - Physics – 01 – N
Patent
G - Physics
01
N
G01N 33/68 (2006.01) C30B 29/58 (2006.01) G01N 23/20 (2006.01)
Patent
CA 2502647
The present invention provides methods for crystallographic structure determination employing hydrogen exchange analysis. Hydrogen exchange analysis is used to identify unstructured regions of a protein, which are then deleted to obtain one or more modified proteins for crystallization and structure determination. Optionally, an initial hydrogen exchange stability map of a protein is compared to that of at least one modified form of the protein to identify unstructured regions, while retaining characteristic structure of the native protein. Hydrogen exchange analysis is performed by determining the quantity of isotope and/or rate of exchange of peptide amide hydrogen(s) with isotope on a labeled protein. Proteins with fewer unstructured regions, and thus improved hydrogen exchange structural maps, are optimal for high quality crystallization and structure determination.
L'invention se rapporte à des procédés de détermination de structures cristallographiques par analyse des échanges d'hydrogène. L'analyse des échanges d'hydrogène est utilisée pour identifier des zones non structurées d'une protéine, qui sont supprimées afin d'obtenir une ou plusieurs protéines modifiées à cristalliser et à en déterminer la structure. Eventuellement, une première carte de stabilité d'échange d'hydrogène d'une protéine est comparée à celle d'au moins une forme modifiée de la protéine pour identifier des zones non structurées, tout en retenant une structure caractéristique de la protéine native. L'analyse de l'échange d'hydrogène est effectuée par détermination de la quantité d'isotopes et/ou du taux d'échange du ou des hydrogènes d'amine peptidique comprenant des isotopes sur une protéine étiquetée. Des protéines comprenant moins de régions non structurées et présentent donc des cartes structurelles d'échange d'hydrogène améliorées, sont optimales pour une cristallisation et une détermination de structure de bonne qualité.
Gowling Lafleur Henderson Llp
The Regents Of The University Of California
LandOfFree
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Profile ID: LFCA-PAI-O-1379938