C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q
Patent
C - Chemistry, Metallurgy
12
Q
C12Q 1/68 (2006.01)
Patent
CA 2444994
The present invention provides novel and unique techniques for high-throughput analysis of genomic material originating from complex biological systems, including complex microbial systems. The present invention also pertains to a method of detecting changes in a genomic material using restriction site tagged (RST) microarrays and sequence passporting technique (in particular microarrays containing NotI-clones). Using the present invention method, methylation or silencing of specific alleles, homozygous and hemizygous deletions, epigenetic factors, genetic predisposition, etc, information which is particularly useful in diagnosis and treatment of cancer diseases, can be detected. The RST microarrays and passporting according to the present invention can also be used for qualitative and quantitative analysis of complex microbial systems.
La présente invention se rapporte à de nouvelles techniques qui s'avèrent uniques pour l'analyse à haut rendement de matériels génomiques provenant de systèmes biologiques complexes, notamment de systèmes microbiens complexes. La présente invention se rapporte également à un procédé de détection de modifications dans un matériel génomique au moyen de microréseaux étiquetés au niveau de sites de restriction (RST) et d'une technique d'établissement de passeports de séquences (en particulier des microréseaux contenant des clones NotI). La mise en oeuvre du procédé de la présente invention permet de détecter la méthylation ou l'extinction d'allèles spécifiques, des délétions homozygotes et hémizygotes, des facteurs épigénétiques, une prédisposition génétique, etc., informations qui s'avèrent particulièrement utiles pour le diagnostic et le traitement de certains cancers. Les microréseaux RST et l'établissement de passeports conformément à la présente invention peuvent également être utilisés pour effectuer une analyse qualitative et quantitative de systèmes microbiens complexes.
Ernberg Ingemar
Kashuba Vladimir
Li Jingfeng
Protopopov Alexei
Wahlestedt Claes
Cassan Maclean
Karolinska Innovations Ab
LandOfFree
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Profile ID: LFCA-PAI-O-1493506