Methods for identifying nucleic acid sequences encoding...

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q

Patent

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C12Q 1/68 (2006.01) C12N 15/10 (2006.01)

Patent

CA 2283261

Methods for identifying nucleic acid sequences that affect a cellular phenotype are disclosed. The method uses a reporter gene whose level of expression correlates with the phenotype in conjunction with a method or device for measuring the level of reporter expression. An expression library is introduced into the cells, and those cells exhibiting changes in reporter expression level are selected. Expression library inserts from the selected cells are isolated, thereby providing a sub-library enriched for sequences that affect the phenotype reflected by the reporter. Further rounds of sub- library introduction and cell selection may be carried out to provide additional enrichment. Sequences identified using this method may be used to ascertain the identity of additional molecules involved in generating the cellular phenotype.

L'invention concerne des méthodes d'identification de séquences d'acide nucléique influant sur un phénotype cellulaire. La méthode fait appel à un gène marqueur dont le niveau d'expression est en corrélation avec le phénotype, conjointement avec une méthode ou un dispositif de mesure du niveau d'expression du marqueur. Une banque d'expression est introduite dans les cellules, et les cellules présentant des modifications dans le niveau d'expression du marqueur sont sélectionnées. On isole des inserts de banque d'expression provenant des cellules sélectionnées, ce qui permet d'obtenir une partie de banque enrichie destinée à des séquences qui influent sur le phénotype reflété par le marqueur. On peut effectuer d'autres séries d'introduction de partie de banque et de sélection de cellules pour obtenir un enrichissement supplémentaire. On peut utiliser des séquences identifiées grâce à cette méthode pour établir avec précision l'identité des molécules supplémentaires intervenant dans la génération du phénotype cellulaire.

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