Methods for identifying small molecules that modulate...

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q

Patent

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C12Q 1/68 (2006.01)

Patent

CA 2493808

The present invention relates to a method for screening and identifying compounds that modulate premature translation termination and/or nonsense- mediated messenger ribonucleic acid ("mRNA") by interacting with a preselected target ribonucleic acid ("RNA"). In particular, the present invention relates to identifying compounds that bind to regions of the 28S ribosomal RNA ("rRNA") and analogs thereof. Direct, noncompetitive binding assays are advantageously used to screen libraries of compounds for those that selectively bind to a preselected target RNA. Binding of target RNA molecules to a particular compound is detected using any physical method that measures the altered physical property of the target RNA bound to a compound. The structure of the compound attached to the labeled RNA is also determined. The methods used will depend, in part, on the nature of the library screened. The methods of the present invention provide a simple, sensitive assay for high- throughput screening of libraries of compounds to identify pharmaceutical leads.

La présente invention concerne une méthode de criblage et d'identification de composés modulant la terminaison de traduction prématurée et/ou la dégradation de l'acide ribonucléique messager (ARNm) induite par mutation non-sens par interaction avec un acide ribonucléique (ARN) cible présélectionné. Plus particulièrement, la présente invention concerne l'identification de composés se liant à des régions de l'ARN ribosomique (ARNr) 28S et d'analogues correspondants. On utilise avantageusement des analyses de liaison non compétitive directe pour cribler des bibliothèques de composés en vue d'identifier les composés qui se lient sélectivement à un ARN cible présélectionné. La liaison des molécules d'ARN cible à un composé particulier est détectée au moyen d'une méthode physique permettant de mesurer la propriété physique modifiée de l'ARN cible lié à un composé. On détermine également la structure du composé fixé sur l'ARN marqué. Les méthodes utilisées dépendent en partie de la nature de la bibliothèque criblée. Les méthodes de la présente invention fournissent une analyse sensible et simple pour le criblage à vitesse élevée de bibliothèques de composés permettant d'identifier des composés pharmaceutiques de pointe.

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