C - Chemistry – Metallurgy – 12 – N
Patent
C - Chemistry, Metallurgy
12
N
C12N 15/74 (2006.01) C07H 21/04 (2006.01) C12N 15/10 (2006.01) C12N 15/30 (2006.01) C12N 15/52 (2006.01) C12Q 1/68 (2006.01)
Patent
CA 2441212
The present invention relates to methods for isolating a gene encoding an enzyme, comprising: (a) adding a mixture of labeled first nucleic acid probes from a microbial strain cultured on medium without the substrate, and labeled second nucleic acid probes from a microbial strain cultured on medium with the substrate, to an array of random nucleic acid fragments of the microbial strain where the labeled nucleic acids hybridize to complementary sequences of the genomic fragments in the array, wherein the first nucleic acid probes are labeled with a first reporter and the second nucleic acid probes are labeled with a second reporter; (b) examining the array under conditions wherein the relative expression of the genes of the microbial strain is determined by the observed hybridization reporter signal of each spot in the array; and (c) isolating a gene from the microbial strain that encodes an enzyme that degrades the substrate. The present invention also relates to isolated genes obtained by such methods.
La présente invention concerne des méthodes qui permettent d'isoler un gène codant une enzyme. Ces méthodes consistent à: a) ajouter un mélange de premières sondes d'acides nucléiques marqués issus d'une souche microbienne cultivée dans un milieu sans le substrat, et de secondes sondes d'acides nucléiques marqués issus d'une souche microbienne cultivée dans un milieu comprenant le substrat, à un jeu ordonné d'échantillons de fragments d'acides nucléiques aléatoires de la souche microbienne à l'emplacement où les acides nucléiques marqués s'hybrident avec des séquences complémentaires des fragments génomiques du jeu ordonné d'échantillons, les premières sondes d'acides nucléiques étant marquées avec un premier gène rapporteur et les secondes sondes d'acides nucléiques étant marquées avec un second gène rapporteur; b) examiner le jeu ordonné d'échantillons dans des conditions telles que l'expression relative des gènes de la souche microbienne soit déterminée par le signal indicateur de l'hybridation constatée de chaque emplacement dans le jeu ordonné d'échantillons; et c) isoler un gène de la souche microbienne codant une enzyme qui dégrade le substrat. L'invention concerne en outre des gènes isolés obtenus par les méthodes de l'invention.
Berka Randy
Yaver Debbie
Novozymes Inc.
Novozymes Biotech Inc.
Ogilvy Renault Llp/s.e.n.c.r.l.,s.r.l.
LandOfFree
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Profile ID: LFCA-PAI-O-1961312