Methods for screening compounds using encapsulated cells

G - Physics – 01 – N

Patent

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G01N 33/549 (2006.01) G01N 33/50 (2006.01)

Patent

CA 2284066

The present invention relates to an integrated approach to drug screening that is designed to couple a screening assay both temporally and spatially to natural product synthesis in a microorganism. The present invention provides a screening unit which is a gel droplet comprising a producing species that produce natural products for the drug screen, and an assay system that detects or measures a desired biological activity. A producing species is coencapsulated with an assay system in a screening unit when the producing species is at a phase in its life cycle that is optimal for producing natural products, such as secondary metabolites. The producing species is spatially positioned relative to the assay system in the same unit such that compounds produced by the producing species can come into contact with the assay system. If a compound possesses the desired activity, the assay system will generate a signal that enables the identification and/or isolation of the screening unit. The present invention also provides methods for forming a screening unit, and methods for using a screening unit in drug screening. The methods are useful for screening naturally occurring organisms as well as genetically engineered cells, and solid carriers containing chemicals.

La présente invention concerne une méthode intégrée de tri de médicaments conçue pour coupler un dosage de tri temporel et spatial à une synthèse de produits naturels dans un micro-organisme. La présente invention décrit une unité de tri qui consiste en une gouttelette de gel comprenant une espèce productive qui produit des produits naturels destinés au tri de médicaments, et un système de dosage qui détecte ou mesure une activité biologique voulue. Une espèce productive est co-encapsulée avec un système de dosage dans une unité de tri lorsque l'espèce productive est à une phase de son cycle vital optimale pour la production de produits naturels, tels que des métabolites secondaires. L'espèce productive est disposée dans l'espace par rapport au système de dosage dans la même unité de telle manière que des composés produits par l'espèce productive puissent entrer en contact avec le système de dosage. Si un composé possède l'activité voulue, le système de dosage génère un signal permettant l'identification et/ou l'isolation de l'unité de tri. La présente invention concerne également des méthodes de formation d'une unité de tri, ainsi que des méthodes d'utilisation d'une unité de tri pour trier des médicaments. Les méthodes selon l'invention s'utilisent pour trier des organismes naturels, et des excipients solides contenant des produits chimiques.

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