C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q
Patent
C - Chemistry, Metallurgy
12
Q
C12Q 1/68 (2006.01) C07H 21/04 (2006.01) C12N 15/09 (2006.01) C12P 19/34 (2006.01) G01N 21/78 (2006.01) G01N 27/447 (2006.01)
Patent
CA 2490864
The invention relates to methods of genotyping single nucleotide differences in a nucleic acid sample. More particularly, the invention provides methods of identifying the nucleotide at a polymorphic site or a group of polymorphic sites in a sample of genomic DNA. The method uses tagged primer extension in which a set of tag sequences correspond to the identity of the nucleotides at the polymorphic sites. Primer extension products are PCR amplified using a common set of tag-specific primers, the downstream primers bearing distinguishable labels. Following separation by size and/or charge, the detection of distinguishable label in a product of the anticipated size determines the identity of the nucleotide at the polymorphic site. The method is well-suited for the genotyping of multiple single-nucleotide differences in one series of reactions.
L'invention concerne des méthodes de génotypage de polymorphismes de nucléotides simples dans un échantillon d'acide nucléique. L'invention concerne plus particulièrement des méthodes permettant d'identifier le nucléotide au niveau d'un site polymorphe ou d'un groupe de sites polymorphes dans un échantillon d'ADN génomique. Cette méthode utilise une extension d'amorce marquée dans laquelle une série de séquences de marquage correspondent à l'identité des nucléotides au niveau des sites polymorphes. Les produits d'extension d'amorce sont amplifiés par PCR à l'aide d'une série commune d'amorces spécifiques à un marqueur, les amorces aval comportant des marqueurs reconnaissables. Après la séparation par taille et/ou par charge, la détection de marqueurs reconnaissables dans un produit de taille prédéterminée indique l'identité du nucléotide au niveau du site polymorphe. La méthode de l'invention est particulièrement adaptée pour le génotypage de plusieurs polymorphismes de nucléotides simples dans une série de réactions.
Primeradx Inc.
Sention Inc.
Torys Llp
LandOfFree
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Profile ID: LFCA-PAI-O-1530884