Methods of monitoring hiv drug resistance

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – N

Patent

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Details

C12N 15/12 (2006.01) A01N 63/00 (2006.01) C07H 21/04 (2006.01) C12N 5/00 (2006.01) C12N 5/02 (2006.01) C12N 5/06 (2006.01) C12N 5/10 (2006.01) C12N 5/16 (2006.01) C12N 13/00 (2006.01) C12N 15/00 (2006.01) C12N 15/09 (2006.01) C12N 15/63 (2006.01) C12N 15/70 (2006.01) C12N 15/74 (2006.01) C12N 15/85 (2006.01) C12N 15/87 (2006.01) C12P 21/06 (2006.01) C12Q 1/68 (2006.01) C12Q 1/70 (2006.01) G01N 33/15 (2006.01) G01N 33/50 (2006.01)

Patent

CA 2358929

A method is provided for detecting a presence of HIV virus in a sample comprising: taking a culture of recombinant cells which (a) are capable of cell division; (b) express CD4 receptor and one or more additional cell surface receptors necessary to allow the HIV virus to infect; (c) enable the HIV virus to replicate and infect the noninfected cells in the cell culture; and (d) comprise a reporter sequence introduced into the recombinant cells comprising a reporter gene whose expression is regulated by a protein specific to HIV viruses which is expressed from a genome of an HIV virus upon infection of the recombinant cell by the HIV virus; contacting the cell culture with a sample to be analyzed for the presence of HIV virus in the sample; and detecting a change in a level of expression of the reporter gene in cells in the recombinant cell culture. The method can be used to detect the presence of HIV virus in a sample, detect the presence of different strains of HIV virus in a sample, detect HIV drug resistance in a sample, determine what combination of one or more anti-HIV agents would be effective in treating a patient, and screen compositions for anti-HIV activity.

L'invention concerne un procédé permettant de détecter la présence du virus VIH dans un échantillon. Ce procédé consiste à: (a) prendre une culture de cellules recombinantes qui peuvent se diviser; (b) exprimer le récepteur CD4 et un ou plusieurs récepteurs de surface de cellule nécessaires pour donner au virus la possibilité d'infecter; (c) permettre la réplication du virus HIV et l'infection des cellules non infectées dans la culture de cellules, et (d) introduire une séquence marqueur dans les cellules recombinantes contenant un gène rapporteur dont l'expression est régulée par une protéine spécifique des virus VIH, ce gène étant exprimé à partir d'un génome de virus VIH lors de l'infection de la cellule recombinante par le virus VIH; mettre en contact la culture de cellules avec un échantillon destiné à être analysé en vue d'y détecter la présence du virus VIH, et détecter une modification dans un niveau d'expression du gène rapporteur dans des cellules de la culture de cellules recombinantes. Ce procédé peut être utilisé pour détecter la présence du virus VIH dans un échantillon, pour y détecter la présence de différentes souches du virus VIH, pour y détecter une résistance du VIH aux médicaments, pour déterminer quelle combinaison à base d'un ou plusieurs agents anti VIH serait efficace dans le traitement d'un patient, et enfin pour rechercher des compositions actives anti VIH.

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