C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q
Patent
C - Chemistry, Metallurgy
12
Q
C12Q 1/68 (2006.01) G06F 19/00 (2006.01)
Patent
CA 2348609
The present invention relates to methods, software, and apparati for determining whether a genomic region harbors a gene associated with a detectable trait. In one embodiment, the present invention relates to a method of confirming that a genomic region harbors a gene associated with a detectable trait comprising the steps of identifying a candidate genomic region suspected of harboring the gene associated with the detectable trait, constructing a trait-associated distribution of association values using the biallelic markers in the candidate genomic region, identifying a plurality of biallelic markers in random genomic regions which are not suspected of harboring the gene associated with the detectable trait, constructing a random distribution of association values using the biallelic markers in the random genomic regions, comparing the trait-associated distribution of association values to the random distribution of association values, and determining whether the trait-associated distribution of association values and the random distribution of association values are significantly different from one another. In other embodiments, the present invention comprises software for performing the above method and devices comprising the software in a retrievable form.
La présente invention concerne des méthodes, un logiciel et des appareils permettant de déterminer si une région génomique héberge un gène associé à un trait détectable. Selon un mode de réalisation, la présente invention concerne une méthode permettant de confirmer qu'une région génomique héberge un gène associé à un trait détectable, ladite méthode consistant à identifier une région génomique candidate que l'on suspecte d'héberger le gène associé au trait détectable, à établir une distribution de valeurs d'association associée audit trait en utilisant les marqueurs bialléliques dans la région génomique candidate, à identifier une pluralité de marqueurs bialléliques dans des régions génomiques aléatoires que l'on ne suspecte pas d'héberger le gène associé au trait détectable, à établir une distribution aléatoire de valeurs d'association en utilisant les marqueurs bialléliques dans les régions génomiques aléatoires, à comparer la distribution de valeurs d'association associée au trait avec la distribution aléatoire de valeurs d'association, et à déterminer si la distribution associée au trait de valeurs d'association et la distribution aléatoire de valeurs d'association sont fondamentalement différentes l'une de l'autre. Selon d'autres modes de réalisation, la présente invention concerne un logiciel permettant de mettre en oeuvre la méthode précitée, ainsi que des dispositifs comprenant ce logiciel sous une forme récupérable.
Blumenfeld Marta
Cohen Daniel
Cohen-Akenine Annick
Essioux Laurent
Schork Nicholas J.
Genset S.a.
Serono Genetics Institute S.a.
Sim & Mcburney
LandOfFree
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Profile ID: LFCA-PAI-O-1893207