Microorganism identification

G - Physics – 06 – F

Patent

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Details

G06F 17/30 (2006.01) H01J 49/04 (2006.01) H01J 49/26 (2006.01) G06F 19/00 (2006.01)

Patent

CA 2264535

The invention relates to a method and apparatus for characterising microorganisms. The invention uses matrix assisted laser desorption ionisation time of flight mass spectrometry (MALDI-TOF-MS) spectral data for a range of known microorganisms. This spectral data is included in a database for spectral data of each of known microorganisms. A sample of an unidentified microorganism is prepared and then subject to analysis by MALDI-TOF-MS techniques to produce the spectral data of the unknown organism. This data is then compared; using suitable comparison means with the spectral data in the database. Similarity indicates the genus while identity indicates the specific microorganism. The apparatus for this analysis has the advantage that once set up and calibrated, it is relatively simple to use.

La présente invention concerne un procédé et un appareil permettant de caractériser des micro-organismes, au moyen de données spectrales obtenues par spectrométrie de masse à temps de vol à désorption et ionisation laser assistée par matrice (MALDI-TOF-MS) pour une gamme de micro-organismes connus. Ces données spectrales sont incluses dans une base de données comprenant des données spectrales pour tous les micro-organismes connus. On prépare un échantillon d'un micro-organisme non identifié et on l'analyse au moyen des techniques MALDI-TOF-MS afin d'obtenir les données spectrales de ce micro-organisme inconnu. On compare ensuite ces données, par des moyens de comparaison appropriés, aux données spectrales contenues dans la base de données. La similarité indique le genre et l'identité indique le micro-organisme specifique. L'appareil utilisé pour cette analyse présente l'avantage d'être relativement facile d'emploi, une fois installé et étalonné.

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