Ms/ms data processing

H - Electricity – 01 – J

Patent

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H01J 49/00 (2006.01)

Patent

CA 2723928

A method of identifying precursor ion species from their fragments comprises obtaining mass spectra of a plurality of precursor ion species and their fragments to high mass accuracy. The fragment mass spectrum, obtained from fragmentation of multiple precursor ion species, is then scanned it identify pairs of fragments whose combined mass matches the mass of one of the precursor ion species. Once pairs of fragment ion shave been matched to precursor ions, the composite fragment ion spectrum is broken down into portions, one per fragment pair. Analysis continues until no further pairs are identified. A simplified fragment ion spectrum is then reconstructed for each precursor sample ion by stitching together the broken down sections of the composite fragment spectrum. The resultant reconstructed, simplified fragment spectra are sent to a search engine which returns a score - sorted list of likely candidates for each synthetic fragment ion spectrum.

L'invention porte sur un procédé d'identification d'espèces ioniques précurseurs, à partir de leurs fragments, qui comporte l'obtention de spectres de masse d'une pluralité d'espèces ioniques précurseurs et de leurs fragments à une précision massique élevée. Le spectre de masse de fragments, obtenu à partir d'une fragmentation de multiples espèces ioniques précurseurs, est ensuite analysé pour identifier des paires de fragments dont la masse combinée correspond à la masse de l'une des espèces ioniques précurseurs. Une fois que des paires d'ions fragments ont été mises en correspondance à des ions précurseurs, le spectre ionique fragment composite est scindé en plusieurs parties, une par paire de fragments. L'analyse continue jusqu'à ce qu'aucune autre paire ne soit identifiée. Un spectre ionique fragment simplifié est ensuite reconstruit pour chaque ion échantillon précurseur par jonction l'une à l'autre des sections scindées du spectre de fragments composite. Les spectres de fragments simplifiés, reconstruits et obtenus sont envoyés à un moteur de recherche qui renvoie une liste triée par score de candidats probables pour chaque spectre ionique fragment synthétique.

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