G - Physics – 06 – F
Patent
G - Physics
06
F
G06F 19/00 (2006.01) C12Q 1/68 (2006.01) G01N 21/25 (2006.01) G01N 30/86 (2006.01) G06F 17/00 (2006.01) G11B 23/00 (2006.01)
Patent
CA 2256686
A signal processing method in a processor is provided for performing a multicomponent analysis of a signal resulting from a spectral response of a mixture comprising a plurality of spectrally resolvable molecular species. The method provides both a determination of a concentration estimate and a statistical confidence interval for each species. In the method, a data vector d is received from a multichannel detector, data vector d having a length nc, nc being the number of detector channels being monitored. A calibration matrix K having nc rows and np columns is provided wherein nc is larger than np, np being the number of spectrally resolvable molecular species. Next, a concentration estimate vector c having length np is determined. Finally, a confidence interval CIi for each of the elements of the concentration estimate vector is determined according to the expression CIi = ci ~ (varcovar(cii))1/2Q(cl, nf) where Q is the critical value of a statistical distribution for a given level of confidence, cl, and a given number of degrees of freedom nf where nf = nc-np. The invention further includes a program storage device embodying the method; a DNA sequencing process employing the method; and, an apparatus for carrying out the method.
L'invention concerne un procédé de traitement de signal mis en oeuvre dans un processeur pour la réalisation de l'analyse de plusieurs composants à partir d'un signal résultant de la réponse spectrale d'un mélange comprenant une pluralité d'espèces moléculaires pouvant subir une résolution spectrale. Le procédé consiste à effectuer à la fois une détermination d'une valeur estimée de la concentration et d'un intervalle statistique de fiabilité pour chaque espèce. Selon ledit procédé, un vecteur de données d est reçu en provenance d'un détecteur multicanal. Ce vecteur de données d a une longueur n¿c?, n¿c? représentant le nombre de canaux de détecteurs surveillés. Selon l'invention, on utilise une matrice d'étalonnage K présentant n¿c? rangées et n¿p? colonnes, n¿c? étant plus grand que n¿p?, et n¿p? étant le nombre d'espèces moléculaires pouvant subir une résolution spectrale. Ensuite, un vecteur de valeur estimée de concentration c d'une longueur n¿p? est déterminé. Enfin, un intervalle de fiabilité CI¿i? est déterminé pour chacun des éléments du vecteur de valeur estimée de concentration, selon l'équation CI¿i? = c¿i? ± (varcovar(c¿ii?))?1/2¿Q¿(cl, nf)?, dans laquelle Q représente la valeur critique de la distribution statistique pour un niveau donné de fiabilité, cl, et un nombre donné de degrés de liberté n¿f?, n¿f? étant égal à n¿c?-n¿p?. L'invention concerne également un dispositif de stockage de programme pour la mise en oeuvre du procédé présenté, un procédé de séquençage d'ADN faisant appel à ce procédé, et un appareil permettant la mise en oeuvre dudit procédé.
Applera Corporation
Perkin-Elmer Corporation The
Sim & Mcburney
LandOfFree
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