Multiple high-resolution serum proteomic features for...

G - Physics – 01 – N

Patent

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G01N 33/48 (2006.01)

Patent

CA 2534336

A well-controlled serum study set (n = 248) from women being followed and evaluated for the presence of ovarian cancer was used to extend serum proteomic pattern analysis to a higher resolution mass spectrometer instrument platform to explore the existence of multiple distinct highly accurate diagnostic sets of features present in the same mass spectrum. Multiple highly accurate diagnostic proteomic feature sets exist within human sera mass spectra. Using high-resolution mass spectral data, at least 56 different patterns were discovered that achieve greater than 85 % sensitivity and specificity in testing and validation. Four of those feature sets exhibited 100 % sensitivity and specificity in blinded validation. The sensitivity and specificity of diagnostic models generated from high-resolution mass spectral data were superior (P < 0.00001) than those generated from low-resolution mass spectral data using the same input sample.

Un ensemble d'examen de sérums convenablement contrôlés (n = 248) provenant de femmes, suivi et évalué quant à la présence de cancer de l'ovaire, est utilisé en vue d'étendre l'analyse d'un modèle protéomique des sérums à une plateforme de spectromètre de masse à haute résolution, afin d'explorer l'existence de multiples séries distinctes de caractéristiques de diagnostics hautement précis, présentes dans le même spectre de masse. De multiples séries de caractéristiques protéomiques de diagnostics hautement précis se présentent dans des spectres de masse de sérums humains. En utilisant des données de spectres de masse haute résolution, au moins 56 modèles différents ont été découverts avec une sensibilité supérieure à 85 %, et une spécificité d'essai et de validité. Quatre de ces séries de caractéristiques ont présenté une sensibilité de 100 % et une spécificité de validité lors d'essais en aveugle. La sensibilité et la spécificité de modèles de diagnostics générés à partir de données de spectres de masse à haute résolution ont été trouvées supérieures (P < 0,00001) à celles générées à partir de données de spectres de masse à faible résolution, en utilisant le même échantillon d'entrée.

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