Multiple tag analysis

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q

Patent

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Details

C12Q 1/68 (2006.01)

Patent

CA 2371843

Disclosed is a method of detecting multiple analytes in a sample in a single assay. The method is based on encoding target molecules with signals followed by decoding of the encoded signal. This encoding/decoding uncouples the detection of a target molecule from the chemical and physical properties of the target molecule. In basic form, the disclosed method involves association of one or more reporter molecules with one or more target samples, association of one or more decoding tags with the reporter molecules, and detection of the decoding tags. The reporter molecules associate with target molecules in the target sample(s). Generally, the reporter molecules correspond to one or more target molecules, and the decoding tags correspond to one or more reporter molecules. Thus, detection of particular decoding tags indicates the presence of the corresponding reporter molecules. In turn, the presence of particular reporter molecules indicates the presence of the corresponding target molecules. The sensitivity of the disclosed method can also be enhanced by including a signal amplification step prior to detection. Medical applications of this method include the analysis of the phenotypic status or replicative status of cells (growth or quiescence) and the assessment of normal and neoplastic cells in histologic or cytologic specimens in normal and disease states. For example, a pathologist may use the method to link a phenotypic state with the protein profile of lesion believed to contain malignant or pre- malignant cells.

L'invention concerne un procédé de détection d'analytes multiples dans un échantillon en un seul essai : on code des molécules cibles avec des signaux, puis on décode les signaux codés. Le codage/décodage dissocie la détection d'une molécule cible par rapport aux propriétés chimiques et physiques de la molécule cible. A la base, ce procédé consiste à associer une ou plusieurs molécules rapporteurs à un ou plusieurs échantillons cibles, à associer une ou plusieurs étiquettes de décodage à cette ou ces molécules rapporteurs, et à déceler les étiquettes de décodage. Les molécules rapporteurs s'associent aux molécules cibles dans le ou les échantillons cibles. En règle générale, les molécules rapporteurs correspondent à une ou plusieurs molécules cibles, et les étiquettes de décodage correspondent à une ou plusieurs molécules rapporteurs. Ainsi, la détection d'étiquettes de décodage particulières indique la présence des molécules rapporteurs correspondantes. A son tour, la présence de molécules rapporteurs particulières traduit la présence des molécules cibles correspondantes. De plus, on peut améliorer la sensibilité du procédé décrit en incluant une étape d'amplification des signaux avant l'étape de détection. Parmi les applications médicales du procédé figurent l'analyse de l'état phénotypique ou de l'état de réplication des cellules (croissance ou quiescence) et l'évaluation des cellules normales et néoplasiques dans des spécimens histologiques ou cytologiques correspondant à des états normaux et pathologiques. Par exemple, un pathologiste peut utiliser le procédé pour lier un état phénotypique au profil des protéines d'une lésion dont on pense qu'elle renferme des cellules malignes ou précancéreuses.

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