Multispecies food testing and characterization

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q

Patent

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C12Q 1/68 (2006.01) C07H 21/04 (2006.01) C12M 1/00 (2006.01) C12M 1/34 (2006.01) C12N 15/00 (2006.01) C12N 15/09 (2006.01) G01N 33/02 (2006.01) G01N 33/48 (2006.01) G01N 33/50 (2006.01) G01N 33/53 (2006.01) G01N 33/569 (2006.01) G01N 33/58 (2006.01) G01N 37/00 (2006.01) G06F 19/00 (2006.01)

Patent

CA 2391314

A testing system useful for food products employs a multispecies testing array to test for presence or amount of a plurality of organisms in a sample by detecting characteristic sequences. A data processing module reads the array to form a multispecies distribution output, and this is processed to provide trend, warning or other data. The array testing and processing sequence may involve culture multiplication, nucleic acid extraction, PCR amplification, labeling of targets and hybridization to the probe matrix array, followed by fluorescence detection and image analysis, to provide information on the presence and/or distribution of a specific group of organisms. The arrays may be configured with different species and gene sequences to effect clinical or diagnostic testing, workplace or environmental testing, and may be applied to other situations.

L'invention concerne un système de test pour produits alimentaires, qui utilise un réseau de test multi-espèces pour tester la présence ou la quantité d'une pluralité d'organismes dans un échantillon par la détection de séquences caractéristiques. Un module de traitement des données lit le réseau de manière à constituer des données de sortie indiquant une répartition multi-espèces, données que l'on traite pour obtenir des données de tendance, d'avertissement ou autres. La séquence de test et de traitement du réseau peut comprendre plusieurs opérations : multiplication de la culture, extraction d'acides nucléiques, amplification PCR, étiquetage des cibles et hybridation du réseau matriciel de sondes, puis détection par fluorescence et analyse des images, qui donnent des informations sur la présence et/ou la répartition d'un groupe spécifique d'organismes. Les réseaux selon l'invention peuvent être configurés avec différentes espèces et différentes séquences de gènes en vue de la réalisation de tests cliniques ou diagnostiques, de tests de l'environnement ou du lieu de travail, et peuvent être appliqués à d'autres situations.

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