Mutant ros expression in human cancer

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – N

Patent

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C12N 9/12 (2006.01) C07H 21/00 (2006.01) C07K 16/18 (2006.01) C07K 16/40 (2006.01) C07K 19/00 (2006.01) C12N 15/54 (2006.01) C12N 15/62 (2006.01) C12Q 1/68 (2006.01) G01N 33/574 (2006.01)

Patent

CA 2744236

The invention provides the identification of the presence of mutant ROS protein in human cancer. In some embodiments, the mutant ROS are FIG-ROS fusion proteins comprising part of the FIG protein fused to the kinase domain of the ROS kinase. In some embodiments, the mutant ROS is the overexpression of wild-type ROS in cancerous tissues (or tissues suspected of being cancerous) where, in normal tissue of that same tissue type, ROS is not expressed or is expressed at lower levels. The mutant ROS proteins of the invention are anticipated to drive the proliferation and survival of a subgroup of human cancers, particularly in cancers of the liver (including bile duct), pancreas, kidney, and testes. The invention therefore provides, in part, isolated polynucleotides and vectors encoding the disclosed mutant ROS polypeptides (e.g., a FIG-ROS(S) fusion polypeptide), probes for detecting it, isolated mutant polypeptides, recombinant polypeptides, and reagents for detecting the fusion and truncated polypeptides. The identification of the mutant ROS polypeptides enables new methods for determining the presence of these mutant ROS polypeptides in a biological sample, methods for screening for compounds that inhibit the proteins, and methods for inhibiting the progression of a cancer characterized by the mutant polynucleotides or polypeptides, which are also provided by the invention. Image

La présente invention concerne l'identification de la présence de la protéine mutante ROS dans les cancers chez l'être humain. Dans certains modes de réalisation, la protéine mutante ROS est une protéine de fusion FIG-ROS comprenant une partie de la protéine FIG fusionnée au domaine kinase de la kinase ROS. Dans certains modes de réalisation, la mutation de la protéine ROS correspond à la surexpression de la protéine ROS de phénotype sauvage dans les tissus cancéreux (ou dans des tissus suspects d'être cancéreux) chaque fois que, dans le tissu normal de même type, ROS ne s'exprime pas ou s'exprime, mais à des niveaux inférieurs. On s'attend à ce que les protéines mutantes ROS de l'invention régissent la prolifération et la survie d'un sous-groupe de cancers humains, en particulier les cancers du foie (y compris ceux du canal biliaire), du pancréas, du rein et des testicules. L'invention concerne donc, pour partie, des polynucléotides isolés et des vecteurs codant pour les polypeptides mutants ROS décrits (par exemple un polypeptide de fusion FIG-ROS(S)), des sondes permettant de les détecter, des polypeptides mutants isolés, des polypeptides recombinants et des réactifs permettant la détection des polypeptides de fusion et des polypeptides tronqués. L'invention concerne également l'identification des polypeptides mutants ROS, ce qui est à l'origine de nouveaux procédés de détermination de la présence de ces polypeptides mutants ROS dans un échantillon biologique, des procédés de criblage de composés inhibant lesdites protéines et des procédés permettant d'inhiber la progression d'un cancer caractérisé par lesdits polynucléotides ou polypeptides mutants.

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