New detection method for cervical hpvs

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q

Patent

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Details

C12Q 1/70 (2006.01)

Patent

CA 2704151

The invention describes a consensus PCR based method (i.e. HRE7- PCR) for the simultaneous detection of 14 Human Papilloma Virus types (i.e. HPV 16, 18, 31, 33, 35, 39, 45, 51, 52, 56, 58, 59, 66, and 68) that are classified as (probably) high-risk, relating to the causation of cervical cancer) and a candidate hrHPV type (i.e. HPV 67) using sets of 6 overlapping forward primers and 9 overlapping backward primers that together amplify a fragment of about (215) to (245) base pairs of the E7 open reading frame of these hrHPV types. For the detection of reaction products an EIA format can be used with the aid of a cocktail of type-specific oligoprobes as exemplified herein. Furthermore, we have developed a method for an efficient typing of these (15) HPVs that is compatible with the method for detection. This RLB typing system involves hybridisation of PCR products with immobilised type-specific oligoprobes.

L'invention porte sur un procédé selon la PCR consensus (à savoir la HRE7-PCR) pour la détection simultanée de 14 types de papillomavirus humains (à savoir HPV 16, 18, 31, 33, 35, 39, 45, 51, 52, 56, 58, 59, 66 et 68) qui sont classifiés comme étant (probablement) à haut risque, en ce qui concerne la cause du cancer du col de l'utérus, et d'un type de hrHPV candidat (à savoir HPV 67) à l'aide d'ensembles de 6 amorces sens se chevauchant et de 9 amorces antisens se chevauchant qui amplifient ensemble un fragment d'environ (215) à (245) paires de base du cadre ouvert de lecture E7 de ces types de hrHPV. Pour la détection de produits de réaction, un format EIA peut être utilisé à l'aide d'un mélange d'oligosondes spécifiques au type tel qu'illustré présentement. De plus, nous avons développé un procédé pour un typage efficace de ces (15) HPV qui est compatible avec le procédé de détection. Ce système de typage RLB entraîne une hybridation de produits de PCR avec des oligosondes spécifiques au type immobilisées.

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