G - Physics – 01 – N
Patent
G - Physics
01
N
G01N 33/68 (2006.01) C12Q 1/32 (2006.01) G01N 33/53 (2006.01) G01N 33/542 (2006.01)
Patent
CA 2373340
Methods for rapidly identifying drug candidates that can bind to an enzyme at both a common ligand site and a specificity ligand site, resulting in high affinity binding. The bi-ligand drug candidates are screened from a focused combinatorial library where the specific points of variation on a core structure are optimized. The optimal points of variation are identified by determining which atoms of a ligand bound to the common ligand site are identified to be proximal to the specificity ligand site. As a result, the atoms proximal to the specificity ligand site can then be used as a point for variation to generate a focused combinatorial library of high affinity drug candidates that can bind to both the common ligand site and the specificity ligand site. Different candidates in the library can then have high affinity for many related enzymes sharing a similar common ligand site.
L'invention concerne des techniques permettant d'identifier rapidement des médicaments candidats pouvant se lier à un enzyme, à la fois au niveau d'un site de ligand commun, et au niveau d'un site de spécificité de ligand, ce qui produit une affinité de liaison élevée. Les médicaments candidats bi-ligands sont criblés à partir d'une bibliothèque combinatoire focalisée, dans laquelle les points de variation spécifiques de la structure de noyau sont optimisés. Les points de variation optimaux sont identifiés par détermination des atomes de ligand liés au site de ligand commun, identifiés comme étant proches du site de spécificité de ligand. En conséquence, les atomes proches du site de spécificité de ligand peuvent ensuite s'utiliser comme point de variation, de façon à produire une bibliothèque combinatoire focalisée de médicaments candidats à affinité élevée, qui peuvent se lier à la fois au niveau d'un site de ligand commun, et au niveau d'un site de spécificité de ligand. Différents candidats de la bibliothèque peuvent ensuite présenter une affinité élevée pour plusieurs enzymes associés partageant un site commun identique.
Pellecchia Maurizio
Sem Daniel S.
Tempczyk-Russell Anna
Gowling Lafleur Henderson Llp
Triad Therapeutics Inc.
LandOfFree
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Profile ID: LFCA-PAI-O-1462173