C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q
Patent
C - Chemistry, Metallurgy
12
Q
C12Q 1/68 (2006.01) C12N 15/10 (2006.01)
Patent
CA 2335343
The invention provides for methods for identification of biologically active biomolecules. In one aspect, a biologically active biomolecule such as RNA or a peptide is identified by incorporating random nucleotide sequences in a scaffold constituted by an enzyme activity modulator, transforming substantially identical host cells with the construct obtained thereby and screening the transformed cells to identify those where a preselected phenotypic trait has been altered. The randomized DNA is subsequently isolated from the phenotypically altered cells and the peptide and/or RNA encoded by the random sequence is determined. In turn, interaction partners which are putative drug targets are identified and isolated by use of the peptide and/or RNA as part of affinity reagents. A preferred scaffold is derived from the potato inhibitor I family of protease inhibitors and exemplified is the barley chymotrypsin inhibitor 2A (CI-2A). Another aspect relates to the identification of novel enzyme inhibitors by using substantially the same approach, but screening specifically for changes in target enzyme activity. Also disclosed are methods of producing the relevant transformation and expression vectors as well as methods for identifying lead compounds and drug targets for use in drug development. Finally, the invention also includes within its scope a method for the preparation of a medicinal product.
Cette invention a trait à des techniques d'identification de biomolécules actives du point de vue biologique. Dans un aspect de l'invention, l'identification d'une biomolécule active du point de vue biologique, de l'ARN ou un peptide, par exemple, se fait par incorporation de séquences nucléotidiques aléatoires dans une structure constituée par un modulateur d'activité enzymatique, par transformation de cellules hôtes sensiblement identiques au moyen du produit de recombinaison ainsi obtenu et enfin par criblage des cellules transformées afin d'identifier celles dans lesquelles un trait phénotypique présélectionné a été altéré. L'ADN rendu aléatoire est, par la suite, isolé des cellules dont le phénotype a été altéré et le peptide et/ou l'ARN codé par la séquence aléatoire est déterminé. A leur tour, des partenaires d'interaction qui sont des cibles présumées de médicament sont identifiés et isolés au moyen du peptide et/ou de l'ARN au titre de réactifs d'affinité. Une structure préférée est dérivée de l'inhibiteur I de la pomme de terre, famille des inhibiteurs de protéase, et, à titre d'exemple est cité, l'inhibiteur 2A de la chymotrypsine de l'orge (C1-2A). Un autre aspect de l'invention porte sur l'identification de nouveaux inhibiteurs enzymatiques, identification réalisée au moyen d'une méthode sensiblement identique, mais faisant intervenir un criblage spécifique des modifications survenues dans l'activité de l'enzyme cible. Cette invention concerne également des procédés de production des vecteurs pertinents de transformation et d'expression ainsi que des méthodes d'identification de composés de tête et de cibles de médicament, utilisables dans le cadre de l'élaboration de médicaments. Enfin, cette invention porte sur un procédé de production de produit médical.
Halkier Torben
Jensen Allan
Jespersen Lene
Inoxell A/s
M&e Biotech A/s
Sim & Mcburney
LandOfFree
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