Nuclease protection assays

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q

Patent

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Details

C12Q 1/68 (2006.01)

Patent

CA 2258745

The invention provides nuclease protection assay, as illustrated in the Figure, comprising: (A) attaching a nucleic acid probe comprising a first nucleotide sequence to a solid surface area; (B) contacting the nucleic acid probe with a nucleic acid template under conditions that promote hybridization between complementary polynucleotides, forming a probe-template complex if the template includes a segment that is complementary to the probe; (C) contacting the probe-template complex with a nuclease effective to selectively cleave the nucleotide bonds of (1) the first nucleotide sequence when the first nucleotide sequence is single stranded or (2) mismatched regions of the first nucleotide sequence when the first nucleotide sequence is in duplex nucleic acid; and (D) detecting the presence of duplex nucleic acids formed by the probe and template nucleic acids by detecting the presence of the first nucleotide sequence.

L'invention se rapporte à un dosage effectué avec protection par une nucléase, tel qu'illustré sur la figure, qui consiste (A) à attacher une sonde d'acide nucléique comportant une première séquence nucléotidique à une aire de surface solide, (B) à mettre en contact la sonde d'acide nucléique avec une matrice d'acides nucléiques dans des conditions favorisant l'hybridation entre des polynucléotides complémentaires, ce qui entraîne la formation d'un complexe sonde-matrice si la matrice comporte un segment qui est complémentaire de la sonde, (C) à mettre en contact le complexe sonde-matrice avec une nucléase capable de scinder sélectivement les liaisons nucléotidiques de (1) la première séquence nucléotidique lorsque cette première séquence nucléotidique est simple brin ou (2) de régions désappariées de ladite première séquence nucléotidique nucléotidique lorsque cette première séquence nucléotidique se trouve dans un acide nucléique double hélice, et (D) à déceler la présence d'acides nucléiques double hélice formés par la sonde et les acides nucléiques de la matrice en procédant à une détection de la présence de la première séquence nucléotidique.

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