Nucleic acid detection method

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – P

Patent

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Details

C12P 19/34 (2006.01) C07H 21/04 (2006.01) C12Q 1/68 (2006.01)

Patent

CA 2478985

Disclosed are methods for detecting a target nucleic acid molecule having a known sequence among a plurality of nucleic acid molecules. The method includes hybridizing two oligonucleotides to adjacent nucleotide sequences on the target nucleic acid molecule, ligating the two oligonucleotides together, and extending a primer that hybrizes to the 3~ end of the oligonucleotide that hybrized to the 5~ nucleotide sequence on the target nucleic acid molecule. If the target nucleic acid molecule is present ( and thereby allowing ligation of the two oligonucleotides), extension of the primer dislodges a detection probe hybridized to the 5~ end of the oligonucleotide that hybridized to the 3~ nucleotide sequence on the target nucleic acid molecule. Also disclosed are kits for performing the methods of the invention.

L'invention concerne des procédés permettant de détecter une molécule d'acide nucléique cible ayant une séquence connue entre plusieurs molécules d'acide nucléique. Le procédé décrit dans cette invention consiste à hybrider deux oligonucléotides à des séquences nucléotidiques adjacentes sur la molécule d'acide nucléique cible; à ligaturer les deux oligonucléotides ensemble; puis à étendre l'amorce qui s'hybride à l'extrémité 3' de l'oligonucléotide s'hybridant à la séquence nucléotidique 5' sur la molécule d'acide nucléique cible. Si la molécule d'acide nucléique cible est présente (et qu'elle permet, ainsi, la ligature des deux oligonucléotides), l'extension de l'amorce décolle une sonde de détection hybridée à l'extrémité 5' de l'oligonucléotide qui est hybridé à la séquence nucléotidique 3' sur la molécule d'acide nucléique cible. L'invention concerne également des trousses permettant de mettre en oeuvre les procédés susmentionnés.

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