Nucleic acid diagnostics based on mass spectrometry or mass...

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q

Patent

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Details

C12Q 1/68 (2006.01) C12Q 1/527 (2006.01) G01N 33/483 (2006.01) G01N 33/50 (2006.01)

Patent

CA 2292039

A method of detecting a mutation or a difference of one or more nucleotides between a nucleic acid molecule to be tested and a reference nucleic acid molecule, said method comprising subjecting the test nucleic acid molecule to base specific cleavage to generate oligonucleotide fragments, separating the resulting oligonucleotide fragments based on mass by MALDI-ATOF MS and/or other equivalent procedure to produce a fingerprint of then oligonucleotide fragments comprising one or more peaks wherein a peak represents the mass of each fragment and identifying an altered peak relative to a reference nucleic acid molecule subjected to the same procedure wherein the presence of an altered peak is indicative of a difference of one or more nucleotides in said tested nucleic acid molecule.

L'invention concerne un procédé de détection de mutation ou de différenciation d'un ou plusieurs nucléotides d'une molécule d'acide nucléique à tester par rapport à ceux d'une molécule d'acide nucléique de référence. Le procédé consiste d'abord à prendre la molécule d'acide nucléique à tester et à la soumettre à un clivage spécifique de la base permettant de créer des fragments d'oligonucléotides. Le procédé consiste ensuite à séparer selon le procédé MALDI-ATOF MS, et/ou par un procédé équivalent, les fragments d'oligonucléotides obtenus en fonction de la masse de façon à obtenir une empreinte des fragments d'oligonucléotides présentant une ou plusieurs crêtes, une telle crête représentant la masse de chaque fragment. Le procédé consiste enfin à identifier une crête modifiée par rapport à une molécule d'acide nucléique de référence subissant le même processus. La présence d'une crête modifiée indique une différence concernant un ou plusieurs nucléotides dans la molécule d'acide nucléique testée.

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