Nucleic acid labeling methods

Details Nucleic acid labeling methods Nucleic acid labeling methods

C - Chemistry, Metallurgy

12

Q

C12Q 1/68 (2006.01) C07H 19/10 (2006.01) C07H 19/20 (2006.01) C07H 21/00 (2006.01) C07H 21/02 (2006.01) C07H 21/04 (2006.01)

Patent

CA 2492212

In one aspect of the invention, a method is provided for end-labeling RNA (total RNA, mRNA, cRNA or fragmented RNA). In one embodiment, T4 RNA ligase is used to attach a 3'-biotinylated AMP or CMP donor to an RNA acceptor molecule. In another embodiment, a pyrophosphate molecule 3'-AppN-3'-linker-biotin is used as donor molecule. In another aspect of the invention, a method is provided for analyzing a nucleic acid population on a nucleic acid microarray comprising providing a nucleic acid population or converting the nucleic acid population into nucleic acid fragments; ligating the nucleic acid population or fragments to a labeled nucleic acid molecule to form labeled nucleic acid population or fragments using a ligase; hybridizing the labeled nucleic acid population or fragments to an array of nucleic acid probes, and determining hybridization signals of the probes as an indication of levels of the nucleic acids in the nucleic acid population.

Dans un aspect, l'invention concerne une méthode de marquage terminal d'ARN (ARN total, ARNm, ARNc ou ARN fragmenté). Dans un mode de réalisation, la ligase de l'ARN T4 est utilisée pour fixer un donneur d'AMP ou de CMP 3'-biotinylé à une molécule d'accepteur d'ARN. Dans un autre mode de réalisation, une biotine lieuse 3'-AppN-3' de molécule pyrophosphate est utilisée comme molécule donneuse. Dans un autre aspect d l'invention, il est prévu une méthode permettant d'analyser une population d'acide nucléique sur un jeu ordonné de microéchantillons d'acide nucléique comprenant les étapes suivantes : préparer une population d'acide nucléique ou convertir la population d'acide nucléique en fragments d'acide nucléique ; ligaturer la population d'acide nucléique ou ses fragments à une molécule d'acide nucléique marqué, de sorte à former une population d'acide nucléique marqué ou ses fragments à l'aide d'une ligase ; hybrider la population d'acide nucléique marqué ou ses fragments à un jeu ordonné d'échantillons d'acide nucléique et déterminer les signaux d'hybridation des échantillons comme indication des taux d'acide nucléique dans la population d'acide nucléique.

Affiliated with

Also associated with

Rating

Nucleic acid labeling methods does not yet have a rating. At this time, there are no reviews or comments for this patent.

If you have personal experience with Nucleic acid labeling methods, we encourage you to share that experience with our LandOfFree.com community. Your opinion is very important and Nucleic acid labeling methods will most certainly appreciate the feedback.

Rate now

Comments { 0 }

Profile ID: LFCA-PAI-O-1916585