C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q
Patent
C - Chemistry, Metallurgy
12
Q
C12Q 1/68 (2006.01) C07B 61/00 (2006.01) C07H 21/04 (2006.01) C12P 19/34 (2006.01)
Patent
CA 2312429
A nucleic acid ligand "biochip" is disclosed, consisting of a solid support to which one or more specific nucleic acid ligands is attached in a spatially defined manner. Each nucleic acid ligand binds specifically and avidly to a particular target molecule contained within a test mixture, such as a bodily fluid. The target molecules include, but are not limited to, proteins (cellular, viral, bacterial, etc.) hormones, sugars, metabolic byproducts, cofactor, and intermediates, drugs, and toxins. Contacting the test mixture with the biochip leads to the binding of a target molecule to its cognate nucleic acid ligand. Binding of target to the nucleic acid ligand results in a detectable change at each specific location on the biochip. The detectable change can include, but is not limited to, a change in fluorescence, or a change in a physical parameter, such as electrical conductance or refractive index, at each location on the biochip. The biochip will then be read by a device, such as a fluorescence scanner or a surface plasmon resonance detector, that can measure the magnitude of the change at each location on the biochip. The location of the change reveals what target molecule has been detected, and the magnitude of the change indicates how much of it is present. The combination of these two pieces of information will yield diagnostic and prognostic medical information when signal patterns are compared with those obtained from bodily fluids of individuals with diagnosed disorders. In principle, the biochip could be used to test any chemically complex mixture provided that nucleic acid ligands to components suspected of being present in the mixture are attached to the biochip. Thus, the nucleic acid ligand biochip will have a wider use in environmental testing, etc.
On décrit une "biopuce" pour ligand d'acide nucléique constituée d'un support solide auquel un ou plusieurs ligands d'acide nucléique spécifiques sont fixés suivant une configuration spatiale. Chaque ligand d'acide nucléique se lie spécifiquement et avidement à une molécule cible particulière contenue dans un mélange d'essai, tel qu'un liquide organique. Les molécules cibles incluent, entre autres, des protéines (cellulaires, virales, bactériennes, etc.), des hormones, des sucres, des sous-produits métaboliques, des cofacteurs, ainsi que des intermédiaires, des médicaments et des toxines. Le fait de mettre en présence le mélange d'essai et la biopuce provoque la liaison d'une molécule cible à son ligand d'acide nucléique apparenté. La liaison de la cible au ligand d'acide nucléique produit une modification décelable à chaque emplacement spécifique sur la biopuce. Cette modification décelable peut inclure, entre autres, un changement de la fluorescence ou un changement du paramètre physique, tel que la conductance électrique ou l'indice de réfraction, à chaque emplacement sur la biopuce. La biopuce est lue ensuite par un dispositif, tel qu'un explorateur de fluorescence ou un détecteur de résonnance plasmique superficielle, pouvant mesurer la magnitude du changement à chaque emplacement sur la biopuce. L'emplacement du changement indique quelle molécule cible a été détectée et la magnitude du changement indique en quelle quantité cette molécule cible est présente. La combinaison de ces deux éléments d'information donne des indications médicales diagnostiques et pronostiques lorsque des configurations de signal sont comparées avec celles obtenues à partir des liquides organiques d'individus chez qui des troubles ont été diagnostiqués. En principe, la biopuce peut être mise en oeuvre pour tester n'importe quel mélange présentant un complexe chimique, à condition que des ligands d'acide nucléique de constituants présumés présents dans le mélange soient fixés à la biopuce. Ainsi, la biopuce pour ligand d'acide nucléique peut avoir un usage étendu en matière d'essai d'enironnement, etc.
Creighton Steve
Drolet Daniel
Gill Stanley
Gold Larry
Jayasena Sumedha
Mbm Intellectual Property Law Llp
Nexstar Pharmaceuticals Inc.
Somalogic Inc.
LandOfFree
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