Nucleic acids for the identification of fungi and methods...

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C - Chemistry, Metallurgy

12

Q

C12Q 1/68 (2006.01) C07H 21/04 (2006.01) C12M 1/34 (2006.01) C12P 19/34 (2006.01)

Patent

CA 2461376

Methods of detecting a dimorphic fungus, including differentiating a dimorphic fungus from other fungi are disclosed. A sample suspected of containing a nucleic acid of a fungus, such as an internal transcribed spacer-2 (ITS2) nucleic acid sequence of a dimorphic fungal rDNA, is screened for the presence or absence of that nucleic acid. The presence of the nucleic acid indicates the sample was contacted by the fungus. Determining whether the nucleic acid sequence is present in the sample can be accomplished by detecting hybridization between a dimorphic probe, species-specific probe, and/or microbe-specific probe and a nucleic acid sequence corresponding to the ITS2 region of fungal rDNA. Kits and arrays for carrying out these methods also are disclosed.

L'invention porte sur des procédés de détection d'un champignon dimorphique, procédés consistant à différentier un champignon dimorphique des autres champignons. Un échantillon, présumé contenir un acide nucléique d'un champignon tel qu'une séquence d'acide nucléique de l'espaceur 2 transcrite interne (ITS2) d'un ADNr fongique dimorphique, est criblé en présence ou en l'absence de cet acide nucléique. La présence de l'acide nucléique indique que l'échantillon a été mis en contact avec le champignon. Il est possible de déterminer si la séquence d'acide nucléique est présente dans l'échantillon en détectant une hybridation entre une sonde dimorphique, une sonde spécifique d'une espèce e/ou une sonde spécifique d'un microbe et une séquence d'acide nucléique correspondant à la région d'ITS2 de l'ADNr fongique. L'invention porte également sur des kits et des matrices permettant de réaliser ces procédés.

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