Nucleobase oligomers

C - Chemistry – Metallurgy – 07 – H

Patent

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Details

C07H 21/00 (2006.01) C07D 239/00 (2006.01) C07D 239/54 (2006.01) C07D 473/00 (2006.01) C07F 9/6561 (2006.01) C07H 19/10 (2006.01) C07H 19/20 (2006.01) C07K 14/00 (2006.01) C12Q 1/68 (2006.01)

Patent

CA 2317677

A novel class of compounds, exemplified by oligomers comprised of purine, pyrimidine, and other nucleobase monomers are disclosed. The nucleobase oligomers hydrogen bond through Watson/Crick base pairing to complementary nucleic acids, such as DNA and RNA, in an opposing strand. Each internal nucleobases in the oligomer has two attachment sites and is attached to two nucleobases by linkers. Terminating groups may contain reactive functionality, labels, reporters, or nucleic acids. The nucleobase oligomer compounds are useful as sequence specific recognition molecules for complementary nucleic acids. Where the molecule consists of sections of nucleobase oligomer and nucleic acid, the chimera may be an enzyme substrate in cleavage, ligation, and primer extension methods such as PCR and DNA sequencing.

On décrit un nouveau groupe de composés, illustré par des oligomères comprenant purine, pyrimidine et d'autres monomères nucléobases. Les oligomères nucléobases présentent une liaison hydrogène, par appariement des bases de Watson et Crick, à des acides nucléiques complémentaires (comme l'ADN et l'ARN), dans un brin opposé. Chaque nucléobase interne dans l'oligomère comporte deux sites de fixation et est liée à deux nucléobases par des lieurs. Des groupes de terminaison peuvent comprendre une fonctionalité réactive, des marqueurs, des ligands ou des acides nucléiques. Les composés d'oligomères nucléobases sont utiles en tant que molécules de reconnaissance spécifique d'une séquence pour des acides nucléiques complémentaires. Lorsque la molécule est constituée de sections d'un oligomère nucléobase ou d'un acide nucléique, la chimère peut être un substrat enzymatique dans des méthodes de clivage, de ligature ou d'élongation d'amorces, telles que l'ACP ou le séquençage de l'ADN.

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