Nucleotide sequences of pestivirus strains, polypeptides...

C - Chemistry – Metallurgy – 12 – N

Patent

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Details

C12N 15/40 (2006.01) A61K 39/187 (2006.01) C07K 14/18 (2006.01) C07K 14/185 (2006.01) C12Q 1/68 (2006.01) C12Q 1/70 (2006.01) G01N 33/569 (2006.01)

Patent

CA 2192940

The invention provides a nucleotide sequence corresponding to a classical swine fever virus (CSFV) genome or a part or a mutant thereof, which comprises at least a part of the nucleotide sequence of the CSFV C-strain depicted in SEQ ID No. 1, or a complement or RNA equivalent of such nucleotide sequence, or which comprises a nucleotide sequence encoding at least the amino acid sequence 268-494 of the amino acid sequence depicted in SEQ ID No. 1, or a complement or RNA equivalent of such nucleotide sequence. Also provided is a pestivirus polypeptide corresponding to the amino acid sequence 690-1063 of SEQ ID No. 1 or part thereof, which contains a mutation in one of the epitopes within amino acid sequences 691-750 or 785-870, said mutation altering said epitope. Further provided is a method of determining the presence of a test substance capable of specifically binding with a binding site of a binding partner, in a sample, by means of competition of said test substance with a measurable amount of a reference substance capable of specifically binding with the same binding site of said binding partner, comprising: (1) contacting said sample with (a) said reference substance bound to a solid carrier, (b) the binding partner of said reference substance, said binding partner molecule containing at least two identical binding sites for said reference substance, and (c) said reference substance provided with a label; (2) measuring the degree of binding of said label to said carrier.

Séquence nucléotidique correspondant à un génome du virus de la peste porcine classique (CSFV), ou à une partie ou mutation de celui-ci, et comportant au moins une partie de la séquence nucléotidique de la souche C de CSFV représentée par SEQ ID No.1, ou un complément ou équivalent ARN d'une telle séquence nucléotidique, ou comportant une séquence nucléotidique codant au moins la séquence d'acides aminés 268-494 de la séquence d'acides aminés représentée par SEQ ID No.1, ou un complément ou équivalent ARN d'une telle séquence nucléotidique. On décrit également un polypeptide de pestivirus correspondant à la séquence d'acides aminés 690-1063 de SEQ ID No.1, ou à une partie de celle-ci, qui contient une mutation dans l'un des épitopes compris dans les séquences d'acides aminés 691-750 ou 785-870, ladite mutation ayant pour effet de modifier ledit épitope. En outre, on décrit un procédé de détermination de la présence dans un échantillon d'une substance à tester apte à se lier de manière spécifique à un site de liaison d'un partenaire de liaison, par compétition entre ladite substance à tester et une quantité mesurable d'une substance de référence apte à se lier de manière spécifique au même site de liaison dudit partenaire de liaison. Ledit procédé consiste (1) à mettre ledit échantillon en contact avec (a) ladite substance de référence liée à un véhicule solide, (b) le partenaire de liaison de ladite substance de référence, la molécule dudit partenaire de liaison renfermant au moins deux sites de liaison identiques pour ladite substance de référence, et (c) ladite substance de référence pourvue d'un marqueur; et (2) à mesurer le degré de liaison entre ledit marqueur et ledit véhicule.

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