C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q
Patent
C - Chemistry, Metallurgy
12
Q
C12Q 1/68 (2006.01) C12Q 1/34 (2006.01)
Patent
CA 2165345
The invention features a method for assaying the ability of an oligonucleotide to form a hybrid with a target nucleic acid sequence. The featured assay comprises the following steps: (a) contacting a test sample containing a target nucleic acid sequence with an oligonucleotide; (b) treating the test sample with a duplex-altering agent; (c) contacting the treated test sample with a labeled probe under stringent hybridization conditions, wherein the probe can hybridize to non-altered target nucleic acid sequence such that the probe label is protected from subsequent chemical inactivation but the probe cannot hybridize to altered target nucleic acid sequence in a manner which would protect the probe label from subsequent chemical inactivation; and (d) measuring the hybridization of the probe to non-altered target nucleic acid sequence by measuring the amount of protected label. Also described is an assay to measure the ability of a ribozyme to cleave a target nucleic acid sequence, and an assay to measure the ability of an agent to alter nucleic acid.
Procédé de dosage de la capacité d'un oligonucléotide à former un hybride avec une séquence cible d'acides nucléiques. Ledit dosage consiste (a) à mettre en contact un échantillon test contenant une séquence cible d'acides nucléiques avec un oligonucléotide; (b) à traiter l'échantillon test avec un agent de modification formant des duplex; (c) à mettre en contact l'échantillon de test traité avec une sonde marquée dans des conditions d'hybridation rigoureuses, la sonde pouvant s'hybrider avec la séquence cible d'acides nucléiques non modifiée de manière à ce que le marqueur de sonde soit protégé de l'inactivation chimique ultérieure, mais la sonde ne pouvant pas s'hybrider à la séquence cible d'acides nucléiques modifiée d'une manière qui protégerait le marqueur de la sonde de l'inactivation chimique ultérieure; et (d) à mesurer l'hybridation de la sonde à la séquence d'acides nucléiques non modifiée en mesurant la quantité de marqueur protégé. Un dosage destiné à mesurer la capacité d'un ribozyme à couper une séquence cible d'acides nucléiques, et un dosage destiné à mesurer la capacité d'un agent à modifier un acide nucléique sont également décrits.
Kacian Daniel L.
Nelson Norman C.
Velarde Jorge Jr.
Gen-Probe Incorporated
Smart & Biggar
LandOfFree
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