C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q
Patent
C - Chemistry, Metallurgy
12
Q
C12Q 1/68 (2006.01) C07H 21/00 (2006.01) C12N 9/00 (2006.01) C12N 9/90 (2006.01)
Patent
CA 2249183
An oligonucleotide having a nucleic acid sequence derived from SEQ ID NO:1 and at least one site capable of amplifying a nucleic acid sequence characteristic of Vibrio parahaemolyticus; the above oligonucleotide having a nucleic acid sequence unavailable from SEQ ID NO:3; the above oligonucleotide incapable of amplifying nucleic acid sequences originating in Vibrio alginolyticus and Vibrio harvei; the above oligonucleotide represented by the sequence of CGG CGT GGG TGT TTC GGT AGT or TCC GCT TCG CGC TCA TCA ATA; and a method of detecting Vibrio parahaemolyticus by preparing a primer set comprising two of the above oligonucleotides, selectively amplifying therewith a DNA gyrase subunit B gene sequence contained in a specimen as a target, and determining whether or not there is a gyrB unit specific for Vibrio parahaemolyticus in the specimen. This method has made it possible to provide a primer which specifically reacts with a gyrB gene of Vibrio parahaemolyticus to thereby differentiate and identify the same among other vibrios and strains other than the genus Vibrio. The primer specific for Vibrio parahaemolyticus serves to detect 285-bp gyrB gene fragments specific for this vibrio by the PCR method without the necessity for DNA extraction or like operations from bacterial cells.
Oligonucléotide possédant une séquence d'acides nucléiques dérivée de SEQ ID N0:1 et, au moins, un emplacement capable d'amplifier une séquence d'acides nucléiques caractéristique de Vibrio parahaemolyticus, cet oligonucléotide possédant une séquence d'acides nucléiques non dérivée de SEQ ID N0:3; cet oligonucléotide étant incapable d'amplifier des séquences d'acides nucléiques provenant de (Vibrio alginolyticus) et de (Vibrio harvei); cet oligonucléotide étant représenté par la séquence de CGG CGT GGG TGT TTC GGT AGT ou TCC GCT TCG CGC TCA TCA ATA. Procédé de détection de (Vibrio parahaemolyticus) consistant à préparer un ensemble d'amorces composée de deux de ces oligonucléotides, à amplifier de façon sélective avec ces derniers une séquence de gènes de sous-ensemble B de gyrase d'ADN contenue dans un spécimen en tant que cible et à déterminer si une unité de gyrB spécifique pour (Vibrio parahaemolyticus) est présente dans le spécimen. Ce procédé permet d'obtenir une amorce réagissant de façon spécifique avec un gène de gyrB de (Vibrio parahaemolyticus), de manière à différencier et à identifier ce gène parmi des vibrions et des souches autres que le genre (Vibrio). L'amorce spécifique pour (Vibrio parahaemolyticus) sert à détecter à détecter des fragments 285-bp du gène de gyrB spécifiques pour ce vibrion au moyen de la méthode PCR sans qu'il soit nécessaire d'extraire l'ADN ou de procéder à des opérations similaires à partir de cellules bactériennes.
Doumoto Nobuhiko
Kasthuri Venkateswaran
Bull Housser & Tupper Llp
Nippon Suisan Kaisha Ltd.
LandOfFree
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