C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q
Patent
C - Chemistry, Metallurgy
12
Q
C12Q 1/68 (2006.01)
Patent
CA 2170264
A method for analyzing a sample oligonucleotide sequence is described. The method comprises contacting the sample oligonucleotide sequence with an anchor sequence which comprises an immobilized oligonucleotide sequence which hybridizes with the sample. The sample is also contacted with a probe comprising an oligonucleotide sequence which hybridizes to a target oligonucleotide sequence to be detected in a suitable buffer to form a complex. The complex is subjected to a field which moves unbound oligonucleotide sequences away from the anchor sequence in the direction of the field, and preferably, extends the sample sequence. Whether the probe is bound to the sample oligonucleotide sequence, and preferably, the position of the probe, is determined to determine whether the target oligonucleotide sequence is present in the sample. The method can be used for mapping, for identity typing, and to determine whether a test oligonucleotide sequence is present in the sample. A device for performing the method and reagents are also described.
L'invention concerne un procédé d'analyse d'une séquence spécimen d'oligonucléotides. Le procédé comprend la mise en contact de la séquence spécimen d'oligonucléotides avec une séquence d'ancrage comprenant une séquence d'oligonucléotides immobilisée qui s'hybride avec le spécimen. Celui-ci est également mis en contact avec une sonde composée d'une séquence d'oligonucléotides s'hybridant à une séquence cible d'oligonucléotides à détecter dans un tampon approprié, afin d'obtenir un complexe. Le complexe est soumis à un champ éloignant les séquences d'oligonucléotides non fixées de la séquence d'ancrage en direction du champ et, de préférence, allongeant la séquence spécimen. On détermine si la sonde est fixée à la séquence spécimen d'oligonucléotides et, de préférence, la position de la sonde, afin de déterminer si la séquence cible d'oligonucléotides est présente dans le spécimen. On peut utiliser le procédé pour établir une carte, pour effectuer un typage d'identité, ainsi que pour déterminer si une séquence test d'oligonucléotides est présente dans le spécimen. L'invention concerne également un dispositif servant à mettre en application le procédé, ainsi que des réactifs.
Genevue Inc.
Smart & Biggar
LandOfFree
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Profile ID: LFCA-PAI-O-1545482