Optically decodable microcarriers, arrays and methods

C - Chemistry – Metallurgy – 40 – B

Patent

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Details

C40B 70/00 (2006.01) C12Q 1/68 (2006.01) C40B 30/04 (2006.01) C40B 40/00 (2006.01) C40B 40/06 (2006.01) G01N 33/53 (2006.01) C07H 21/04 (2006.01)

Patent

CA 2518147

A coding scheme for microcarriers suitable for use in distributed arrays includes labeling the carriers with quenched signaling hairpin molecules with any one of three to eight distinguishable fluorophores wherein the hairpins are of at least two types, most preferably three types, that open and fluoresce differentially as a chemical or physical condition, for example temperature, is changed. Mixtures of microcarriers having immobilized capture probes can be decoded by measuring fluorescence from said fluorophores under conditions under which only one type of hairpin is open, under which two types of hairpin are open, and so on. Mixtures of coded microcarriers with capture probes are used in assays for nucleic acids utilizing microarray methods.

L'invention concerne un système de codage de microsupports adaptés pour être utilisés dans des jeux ordonnés d'échantillons distribués, consistant à étiqueter les supports à l'aide de molécules de signalisation en épingles à cheveux désactivées comprenant de trois à huit éléments fluorescents distincts, les épingles à cheveux étant de deux types au moins, plus préférablement de trois types, s'ouvrant et émettant une fluorescence de manière différente en fonction du changement d'une condition chimique ou physique, par exemple la température. Des mélanges de microsupports comprenant des sondes de capture immobilisées peuvent être décodés par mesure de la fluorescence desdits éléments fluorescents dans des conditions dans lesquelles un type seulement d'épingle à cheveux est ouvert, dans lesquelles deux types d'épingles à cheveux sont ouverts, etc.. Ces mélanges de microsupports codés comprenant des sondes de capture sont utilisés dans des dosages d'acides nucléiques à l'aide de méthodes dans lesquelles sont utilisés des jeux ordonnées de microéchantillons.

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