C - Chemistry – Metallurgy – 12 – Q
Patent
C - Chemistry, Metallurgy
12
Q
C12Q 1/68 (2006.01) C07H 21/04 (2006.01) C12M 1/34 (2006.01) C12P 19/34 (2006.01) C12Q 1/48 (2006.01)
Patent
CA 2440146
This invention relates to methods and compositions for determining single nucleotide polymorphisms (SNPs) in P450 genes. In preferred embodiments, self extension of interrogation probes is prevented by using novel non self- extension probses and/or methods, thereby improving the specificity and efficiency of P450 SNP detection in target samples with minimal false positive results. The invention thus describes a variety of methods to decrease self- extension of interrogation probes. In addition, this invention provides a unique collection of P450 SNP probes on one assay, primer sequences for specific amplification of each of the seven P450 genes and amplicon control probes to evaluate whether the intended p450 gene targets were amplified successfully. The invention also describes a variety of array platforms for performing the assays of the invention; for example: CodeLinkTM, eSensorTM, multiplex arrays with cartridges etc., all described herein.
La présente invention concerne des procédés et des compostions permettant la détermination de polymorphismes à simple nucléotide dans des gènes P450. Dans des modes de réalisation préférés, on évite l'autoextension des sondes d'interrogation par l'utilisation de sondes ne présentant pas d'autoextension, améliorant ainsi la spécificité et l'efficacité de détection de polymorphismes à simple nucléotide P450 dans des échantillons cibles réduisant au minimum des résultats positifs erronés. A cet effet, l'invention propose une variétés de procédés permettant de réduire l'autoextension des sondes d'interrogation. En outre, l'invention propose une collection unique de sondes de polymorphismes à simple nucléotide de P450 sur une bioanalyse, des séquences d'amorce pour l'amplification spécifique de chacun des sept gènes P450 et des sondes de contrôle d'amplicons pour déterminer si les cibles désignées de gènes P450 ont été effectivement amplifiées. L'invention concerne également une variété de plates-formes de jeux ordonnés d'échantillons permettant d'effectuer les bioanalyses de l'invention, par exemple: Codelink?MD¿, eSensor?MD¿, avec des cartouches multicouches de jeux ordonnés d'échantillons, qui y sont toutes décrites.
Chui Buena
Elghanian Robert
Fermin David R.
Gu Zhijie John
Gupta Vineet
Amersham Biosciences Ab
Fetherstonhaugh & Co.
Ge Healthcare Bio-Sciences Ab
LandOfFree
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Profile ID: LFCA-PAI-O-1800020