C - Chemistry – Metallurgy – 07 – H
Patent
C - Chemistry, Metallurgy
07
H
C07H 21/00 (2006.01) G06F 19/20 (2011.01) C12Q 1/68 (2006.01) C40B 30/04 (2006.01)
Patent
CA 2736124
This invention relates to new insights into the pathogenesis of pancreatic cancers by analyzing the genes altered in 24 pancreatic tumors. First, we determined the sequences of 23,781 transcripts, representing 20,583 protein-encoding genes, in DNA from these tumors. Second, we searched for homozygous deletions and amplifications using microarrays querying one million single nucleotide polymorphisms in each sample. Third, we analyzed the transcriptomes of the same samples using SAGE and next-generation sequencing-by-synthesis technologies We found that pancreatic cancers contain an average of 63 genetic alterations, of which 49 are point mutations, 8 are homozygous deletions, and 6 are amplifications. Further analyses revealed a core set of 12 regulatory processes or pathways that were each genetically altered in 70 % to 100 % of the samples. The data suggest that dysregulation of this core set of pathways is responsible for the major features of pancreatic tumorigenesis.
Il existe actuellement peu d'options thérapeutiques pour les patients atteints d'un cancer pancréatique, et une mise à jour des connaissances sur cette maladie mortelle est urgente et nécessaire. Dans ce but, la présente invention porte sur une analyse complète des gènes altérés dans les 24 tumeurs pancréatiques. En premier lieu, l'invention comprend la détermination des séquences de 23 781 transcrits, représentant 20 583 gènes codant pour des protéines, dans l'ADN provenant desdites tumeurs. En deuxième lieu, l'invention comprend la recherche de délétions et d'amplifications homozygotes à l'aide de micromatrices permettant d'interroger un million de polymorphismes touchant un nucléotide unique dans chaque échantillon. En troisième lieu, l'invention comprend l'analyse des transcriptomes des mêmes échantillons à l'aide de l'analyse SAGE et de technologies de séquençage par synthèse de nouvelle génération. Il a été ainsi découvert que les cancers pancréatiques contiennent une moyenne de 63 altérations génétiques dont 49 sont des mutations ponctuelles, 8 sont des délétions homozygotes et 6 sont des amplifications. Des analyses supplémentaires ont révélé l'existence d'un ensemble central de 12 processus ou voies de régulation, génétiquement altérés pour chacun d'eux dans 70 à 100 % des échantillons. Les données suggèrent que la dysrégulation de cet ensemble central de voies est responsable de la plupart des caractéristiques de la tumorigenèse pancréatique.
Angenendt Philipp
Eshleman James R.
Goggins Michael
Hruban Ralph
Jones Sian
The Johns Hopkins University
Torys Llp
LandOfFree
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Profile ID: LFCA-PAI-O-1720179