Pcr-hybridization assays specific for integrated retroviruses

Details Pcr-hybridization assays specific for integrated retroviruses Pcr-hybridization assays specific for integrated retroviruses

G - Physics

01

N

G01N 33/569 (2006.01) C12Q 1/70 (2006.01) G01N 33/50 (2006.01)

Patent

CA 2405940

The present invention provides a method of determining latent HIV infection by detection low-abundant HIV nucleic acid sequences in samples of cellular DNA or in paraffin-fixed tissue sections or frozen sections. This technique calls for one primer for an Alu sequence in the human chromosomal DNA and the other primer near the end of the viral LTR. PCR-amplified DNA is then hybridized with a probe which only recognizes the amplified LTR sequence. This probe could be labeled in different ways, and quantitative assays for latent HIV or other retorviruses infection could be developed.

La présente invention concerne une méthode permettant de déterminer une infection latente par le VIH, consistant à détecter les séquence d'acides nucléiques du VIH de faible abondance dans des échantillons d'ADN cellulaire ou dans des parties de tissus fixées par la paraffine ou des parties congelées. Cette technique concerne également une amorce pour une séquence Alu dans l'ADN chromosomique humain et une autre amorce près de l'extrémité du LTR viral. On effectue alors l'hybridation de l'ADN amplifié par PCR au moyen d'une sonde ne reconnaissant que la séquence LRT amplifiée. Cette sonde peut être marquée de différentes façons, et des dosages quantitatifs d'infections latentes par le VIH ou par d'autres rétrovirus peuvent être développés.

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