Peptide fragmentation

G - Physics – 01 – N

Patent

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G01N 33/68 (2006.01) C12Q 1/37 (2006.01) G01N 30/72 (2006.01) G01N 33/58 (2006.01) G06F 19/00 (2006.01)

Patent

CA 2446199

The present invention relates to a method of identifying a polypeptide using a class of novel, water-stable reagents. More specifically, the method according to the invention comprises the steps of (a) derivatization in an aqueous solution of the N-terminus of the polypeptide, or the N-termini of one more peptides of the polypeptide, with at least one acidic reagent which comprises a sulfonyl moiety coupled to an activated acid moiety to provide one or more peptide derivatives; (b) analyzing at least one such derivative using a mass spectrometric technique to provide a fragmentation pattern; and (c) interpreting the fragmentation pattern. Furthermore, the present invention also relates to a kit and novel reagents for use in the present method.

La présente invention concerne un procédé d'identification d'un polypeptide à l'aide d'une classe de nouveaux réactifs stables à l'eau. Le procédé de la présente invention consiste plus précisément (a) à procéder à la dérivation en solution aqueuse du N-terminal du polypeptide, ou des N-termini d'un ou de plusieurs peptides du polypeptide, avec au moins un réactif acide comprenant un fragment sulfonyl couplé à un fragment acide activé, pour obtenir un ou plusieurs dérivés peptidiques ; (b) à analyser au moins un de ces dérivés par technique de spectrométrie de masse pour obtenir un schéma de fragmentation ; et (c) à interpréter le schéma de fragmentation. La présente invention concerne également un nécessaire et des nouveaux réactifs destinés à être utilisés dans le présent procédé.

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