Peptides causing formation of compact structures

C - Chemistry – Metallurgy – 07 – K

Patent

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C07K 7/06 (2006.01) C07K 1/04 (2006.01) C07K 14/00 (2006.01) C07K 14/47 (2006.01)

Patent

CA 2324284

The present invention is directed to compositions and methods comprising peptides which have a high affinity for each other and, when linked to a protein, are used to help fold the protein into a compact structure. By virtue of its stability and constraints, this scaffold can prolong the activity of any embedded protein sequences in the presence of cellular and other proteases. The compact structure can have other functional sequences embedded, and is preferable to linear and less constrained peptides for library screening, for creating structurally-biased peptide libraries and for targeting to specific intracellular and extracellular compartments. Compositions of the present invention can be displayed on the surface of viruses, archaebacteria, prokaryotic and eukaryotic cells for library screening, drug screening and display. Methods of the present invention are useful for screening in vivo for intracellular effector proteins modulating signaling pathways and to identify interacting proteins in vitro. Thus, the present invention is useful as a scaffold for gene therapy, for the isolation of new therapeutic drug leads and for potential use as a therapeutic in physiological fluids.

L'invention concerne des compositions et des procédés basés sur des peptides possédant une affinité importante les uns pour les autres et qu'on utilise, lorsqu'ils sont liés à une protéine, afin de contribuer à plier la protéine en structure compacte. Sa stabilité et ses contraintes permettent à cette charpente de prolonger l'activité de toutes séquences de protéines encastrées en présence de protéases cellulaires ou d'autres protéases. D'autres séquences fonctionnelles peuvent être encastrées dans cette structure compacte qui est préférable à des peptides linéaires et moins contraints pour cribler une banque, créer des banques de peptides à orientation structurelle et cibler des compartiments spécifiques intracellulaires et extracellulaires. On peut exposer ces compositions à la surface de virus, d'archaeobactéries, de cellules procaryotes et eucarytotes afin d'effectuer un criblage de banque, une recherche de médicaments et un affichage. Ces procédés sont utiles pour rechercher par criblage in vivo des protéines effecteurs intracellulaires modulant des trajets de signalisation et identifier des protéines interactives in vitro. Cette invention est, de ce fait, utile en tant que charpente de thérapie génique, afin d'isoler de nouveaux précurseurs de médicaments thérapeutiques et d'être mise en application potentielle en tant qu'agent thérapeutique dans des fluides biologiques.

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